過去ログではこのあたりが該当しそうです。
http://weblabo.griffonworks.net/dorlog/2nddorcom/98maniacs/23349.html
http://weblabo.griffonworks.net/dorlog/2nddorcom/pc-98/49708.html

参考
http://www.h3.dion.ne.jp/~midoriya/user/kazzez/essay/athdform.htm

うげげ、自分でコメントしてるスレッドヤン（超大汗　穴が無くても掘って入りたい気分

大熊猫さんのは確かIDE接続のHDDだけだったからSCSIはダメだっけナァと、質問を書いたのですが、98DESTROY のことをすっかり忘れてました．．　*(. .)*　これから試して事後報告しますです。

> IDE接続のHDDだけだったからSCSIはダメだっけ
あ・・・そういえば。(恥
大容量のHDDになるとIDE-SCSI変換が当たり前になっていたので
うっかりしていました・・・。

NEWHDにはソースが含まれていますから、
DA/UAをSCSI-HDDに書き換えればよいのかもしれませんが、
ハードウエアやアセンブラに詳しくないとリスクが大きそうです。

代換手段として、NEWHD作成のきっかけとなった「rwMBR」でしたら
SCSIにも対応していたかと思います。ただしこの場合、
00hで埋めたダミーのデータを用意しておく必要があります。

98DESTROYは使ったことがないのですが、
先頭のわずかな範囲だけフォーマットすればよいので
途中で中止すればよいのでしょうか?
ふと思ったんですが
SCSIボードのBIOSで高速フォーマットを有効にしていたら
どうなるのでしょうね。

SCCTL でファイルをセクタに書き込むというコマンドがありますから、512バイトのゼロばかりでできたファイルを作ってセクタ１に書き込んでみてはどうでしょう。
ゼロばかりのファイルが作りにくい場合は、改行を256回入力した物でも目的は達成できるかと。

> セクタ１に書き込んでみてはどうでしょう。
PC-98のブートメニューはセクタ2-14にあるそうなので、セクタ0または1ではだめみたいです。
http://weblabo.griffonworks.net/dorlog/2nddorcom/pc-98/47502.html
これを見ると最低でも8-12KBのファイルが必要そうです・・・。
COPY /Bとかで倍々に増やしていく手もありますが、バイナリエディタが必要でしょうね。

> 穴が無くても掘って入りたい気分
いえこちらこそ。m(_ _;)ノ

ロジテックのLHD-E80SU2のガワに120GなIDE-HDDを入れてSCSI外付けとして試してみました。

まず98DESTROYですが、SC-UPCIでは、ソフトは起動するものの実際の消去操作が一瞬で終わり、何も書き込まれません。BIOSのクイックフォーマットはOFFにしてあるのですけどね。CHANPON3の方だと98DESTROYが起動すらできません。

ということで、上記の組み合わせではだめなようです。
SCCTLは間違いなできそうな気がするのでまだ試してません（汗

SCSI-BIOSは縁遠いですし色々手段はあるので恐縮ですが、
せっかくなのでSCSI-BIOSにも対応させました。> NEWHD
http://homepage3.nifty.com/ookumaneko/newhd.htm
もしよろしければお使い下さい。

> DA/UAをSCSI-HDDに書き換えればよいのかもしれませんが、
やっつけ仕事で作ったため、ソースが激汚いのでむしろ1から書いたほうが
余程ましではないかと思います(^^;;;

ども、大熊猫さん、ご無沙汰してます

さっそく使わせてもらいます。SC-UPCI、怪しいBIOSのCHANPON3とも動作ばっちりです。
98なフォーマットで使っていたHDDをAT機に流用する際の、必須ソフトになりそうですね。

zafさんこんばんは。
問題なく使えているとのことで良かったです。
ちなみにうちではRvII26内蔵SCSIで動作確認を取りました。