ノイズが原因でしょうか・・・？
でも、フィルタを数ヶ通している私のノートでさえ４６６６６ｂｐｓが最高なので、
妥当な数字ではないでしょうか？

電話線はできるだけ短いものを使い、パソコン本体やモニタ、他のケーブル、コード類からは離すようにしてください。
あと、電話線をモデムから電話器に分配している場合は、モデムを使う時だけ電話器の配線を外してみてください。
もしも本当にノイズが原因なら、これでかなり改善されると思います。

私もV16S5で一時期 DFML-560 を使ってましたがたしかに不安定でした。
（相性とかあるんでしょうかねえ？）いろいろやり、少し改善した
のですが、まだまだ不安定だったため買いなおしてしまいました。　
結構このモデムで苦しんだ人はいるみたいですよ。　
ちなみにこの時は　PL-J98＋K6-2 400Mhz と VDB16 でした。

皆さん情報ありがとうございます。ノイズの可能性は考えたのですが、ODPとGAを取り付けてノイズが発生することってあるのでしょうか？モデムもかなり安くなったようですし買い直しますか…。

K-6IIIとBansheeという電力を喰うDEVICEを追加→電源ヘナヘナときて、負荷増大に
よる電源からのノイズ増加、というのはありえると思います。

44kでネゴしてて、モデム周りはいじってないのに転送だけが異様に遅くなり、そこで
33600に抑える…というのがよく判らないんですが、これで速度低下が緩和されるので
しょうか？ WGP-FX16N追加によって、RSA98-III/Sのリソースがコケてるとか？

これがまた腹立たしい位33600にすると速くなるというか、普通になるんですよ。33600に抑えるのは、安定しないときはATコマンド(でしたっけ?)を入れて速度を落とせとマニュアルに書いてあったので…。リソースとかそういう所で問題点はなかったです。

電源からのノイズなんてあったんですね。そのせいなのかなぁ？また一つ勉強になりました。

ＣＰＵファンからのノイズもあるかもしれませんね。
誘導電流ってヤツです。
あとは、ノイズフィルタ（コア）を使用してないなら、
付けてみるといいですよ！