LHA-301上のスイッチは55互換(非PnP)モードに設定されているでしょうか?
http://ematei.hp.infoseek.co.jp/~miyabi/data/lha-301.txt

PnPモードでも一応使えますが、I/Oポートが異なりますので、
ドライバによってはCD-ROMを認識できないのかもしれません。

>ＭＯとＣＤＲＯＭのＩＤをいろいろと変更しましたが
(1)MOを接続せず，CD-ROMのSCSI-IDを1にしてもダメですか？
(2)LHA-301の転送モードをDMA転送にしてもダメですか？
(3)あまり関係ないと思いますが，SCSI-2用ケーブル＋アクティブターミネータを使っていますか？
うちではFA等＋SMIT転送モードのLHA-301(A)でCD-ROMが問題なく使えています。何も特別なことはしていません。

家ではまさに、そのPC-9801DA+LHA-301の組み合わせで、動作してますよ。
CD-ROMも、特に苦も無く認識しましたが。
Windows95で、非PnPモードにしてあります。

ところで、ＯＳは何ですか？
Win95か98でしょうか？
だとすると、もしかして、LHA-301自体が、Windowsから正しく認識されてないのでは？
あるいは、IRQやIOポートなどのリソースが一致してないとか？
システムのデバイスマネージャーで、SCSIコントローラーはどうなってます？
また、システムのパフォーマンスで、HDDやMOが「MS-DOS互換モード」になってませんか？
SCSIコントローラーが正しく認識されてないと、そうなります。

あ、しばらく使っていないDAということなので、てっきりDOSの話
かと思っていましたが、95/98の可能性もあるのですね。

ただ、もともと55ボードを95で使っていたのであれば、
CD-ROMはDOSドライバで認識させることなっています。
# オンラインマニュアルには55/55Lに対してそう書かれています。
# 9821Ceのオンボード55相当SCSIで試したところ、95の55ドライバでも認識はできましたが
# CDのドライブレターの指定をするとCe内蔵CDが使えませんでした。
(マニュアル確認したので一部訂正)

もし55Uとかで95ネイティブドライバで認識させていたのであれば、
たしかにSCSIボードを替えることでCDだけ認識しなくなる可能性があります。

あと可能であれば、どのようなCD-ROMドライブをお使いか、
メーカーや型番を示されても良いかもしれません。
DAで55ボード接続なら、かなり古い製品が使われている可能性があります。
基本的にDOSドライバもドライブ付属のものをお使いかと思われますが、
ドライバのバージョンが古いとI/Oポートも決め打ちの可能性がありますので。

基本的な事なのですが...

1.CD-ROMドライブが壊れていないか.
2.SCSI-BIOSの設定で起動時にボードが認識するIDに制限をかけていないか(IDスキャン短縮).
3.同じくCD-ROMドライブのIDスキャン時間を「短く」に設定していないか.

については確認されましたでしょうか。

HDDやMOとは違ってCD-ROMやDVD関連のドライブはSCSIボードがドライブを認識するのに(SCSIボードの問いかけに対してドライブ側が返答するのに)時間がかかる場合が多々ありますので、まずは「3.」辺りを疑ってみてはいかがでしょうか。

早速、皆さんからいろいろとご回答をいただき、ありがとうございます。

皆さんからのご回答を見て、質問で基本的なところを書くことを忘れていました。

それは、今回、ＣＤ−ＲＯＭドライブを認識できないと言っている場面は、
「ＬＨＡ−３０１のＳＣＳＩ−ＢＩＯＳのＩＤスキャンにおいて」
ＬＨＡ−３０１がＣＤ−ＲＯＭドライブを認識できないということです。

この度、ＬＨＡ−３０１のＳＣＳＩバスに繋いでいるＣＤ−ＲＯＭドライブは、
プレクスター製の「ＰＸ−４３ＣＳ」ですが、
５５ボードでは認識して、ＭＳ−ＤＯＳ（当然ＡＳＰＩマネージャーとドライバを
使用してですが）やＷｉｎｄｏｗｓ９５で使用実績のあるものです。

また、ご指摘いただいたＬＨＡ−３０１のＳＣＳＩ−ＢＩＯＳのＩＤスキャンは、
自身のホストとしてのＩＤ＝７までスキャンをしていることは確認しています。

ＨＤＤ、ＭＯをＬＨＡ−３０１のＳＣＳＩバスに繋がず、ＣＤ−ＲＯＭドライブを
単独でＩＤ＝０に設定して繋いだだけでも、ＳＣＳＩ−ＢＩＯＳのＩＤスキャンで、
このＣＤ−ＲＯＭドライブを認識できません。

それに、ＳＣＳＩケーブルやターミネータなども、５５ボードで使用実績のあるものを
そのまま使用しております。今回、ＳＣＳＩボードを換装しただけですが、
ＬＨＡ−３０１のＳＣＳＩ−ＢＩＯＳのＩＤスキャンでＣＤ−ＲＯＭドライブを認識して
くれず、ここまで途方に暮くれています。

たいへん恐縮しますが、皆さんから、更なる貴重なアドバイス、コメントを
いただけますように、よろしくお願いします。

以上

>ＳＣＳＩケーブルやターミネータなども、５５ボードで使用実績のあるもの
通称55ボードはSCSI-1の規格ですので、「総額7600円」さんの仰っている(3)が原因で認識されない可能性もあります(LHA-301及びPX-43CSはSCSI-2規格)。

>自身のホストとしてのＩＤ＝７までスキャンをしていることは確認しています。
IDスキャン時間内にSCSI機器からの返答が無いとそのIDには何も繋がっていないとSCSIボードは考えますので、そのままID：7まで通ってしまうのではないでしょうか。その点については書かれていらっしゃらないのであくまで推測ですが、もしそうでしたらIDスキャン時間を「長く」に設定してみて下さい。

>「ＬＨＡ−３０１のＳＣＳＩ−ＢＩＯＳのＩＤスキャンにおいて」
>ＬＨＡ−３０１がＣＤ−ＲＯＭドライブを認識できないということです。

そうゆう事だったのですか。
とりあえず、まだ、ロジテックからマニュアルもドライバーもダウンロード可能ですね。
起動時にCTRL+Lで、セットアップモードになります。
試しに、家のＤＡのCD-ROMのIDの６を×に設定しましたら、デバイススキャンでは、passと表示されましたので、ボードの設定で、IDに制限をかければすぐに判るようになってますね。
>3.同じくCD-ROMドライブのIDスキャン時間を「短く」に設定していないか.
その設定ようなは無いようです。

さあて、わからなくなりました。
何故、認識してくれないのでしょうね。

あ、本当だ、ないですねぇ...（汗）
SMIT転送のボードなので設定も同じと思い込んで適当な事を言ってしまいました。<(_ _)>
と致しますと選択肢の減った分、現状での解決は難しいかもしれないですねぇ...

CD-ROMドライブならBIOSで認識する必要はないと思いますが・・・。
実際にDOSや95から使えない状態なのでしょうか?

ベクターのSCSI.COMあたりでCD-ROMの存在自体は認識できるのでしょうか?
また、55ボードに戻せば認識するのでしょうか?
そうでなければ最近故障した可能性もありそうです。

直接の解決方法にはならず恐縮ですが、デバイスマネージャの「更新」釦を押下しても認識されませんでしょうか。

>また、55ボードに戻せば認識するのでしょうか?
「Ｙｅｓ」です。
ＬＨＡ−３０１とプレクスター製の「ＰＸ−４３ＣＳ」の合性なのでしょうか！？！
それとも、ＬＨＡ−３０１のＳＣＳＩ規格（−２）とプレクスター製の「ＰＸ−４３ＣＳ」の
ＳＣＳＩ規格（−１）が違ってることが原因でしょうか！？！
いずれにしても、ＬＨＡ−３０１のＳＣＳＩ−ＢＩＯＳのＩＤスキャンでプレクスター製の「ＰＸ−４３ＣＳ」が
認識できないという事実が解りました。

以上