以前V200青札系など4.3GBの壁がない機種で8GB以上のHDDを正常にフォーマットするのを補助するソフトがありましたが、そのソフトを公開していたページは消え、そのソフトの再配布も禁止されていたので現在では入手できません

4.3GBの壁がない機種なら、UIDE−98M等で繋いでフォーマットまで済ませてしまえば、内蔵IDEでも使えたと思います。たしか。
32GBまではいけるのかな…?

４．３Ｇの壁のある機種では、フォーマットしてあるＨＤＤでも、マザーボードのＩＤＥのＢＩＯＳがそのままでは、４．３きを超えるＨＤＤを内蔵ＩＤＥインターフェースに接続して起動することができません。
マザーボードのＢＩＯＳにパッチを当てるソフトが開発されたのですが、転載・譲渡禁止だった上に現在ホームページは閉鎖されています。
なお、メルコの製品に添付のソフトウエアで、そのような働きをする物があります。
このソフトにより、４．３Ｇの壁がある機種で、８Ｇが使えます。
このプログラムと、閉鎖されたホームページで公開されていたソフトとの関係が噂されていますが…
実際に、関係があるのかどうかは、（私は）知りません。
と、ここまでは４．３Ｇの壁の話です。

８Ｇの壁というのは、Ｖ３桁マシンなどで内蔵ＩＤＥに８Ｇまで仕様できる機種を、３２Ｇまで使用できるようにするソフトです。
これは、４．３Ｇの壁の物とは全く別物です。もちろん今でも入手できます。
したがって、内蔵ＩＤＥに４．３Ｇの壁がある機種では、このソフトを使っても８Ｇ以上はもちろん、８Ｇ以下であっても４．３Ｇを超えたら使用できません。

http://www.melcoinc.co.jp/qa/format.html
これなんか如何なものでしょうか？

http://www.melcoinc.co.jp/qa/format.html
試して見てください。