>壊れると店員さんに言われたのはマザーボードの方なのですが、12Vと5Vが反転してしまう
>というのは、HD側のコネクタも反転した物が存在するということなのでしょうか?
ドライブ自体は普通のものですが、マザーボード(というより電源)からのアサインが逆なんです。御買いになったケーブルで今ついているHDDやCD-ROMドライブに入っていく電源コネクタを、ドライブの手前で分岐するならなにも問題はないはずです。
職場でもXe復活作戦中にHDD2台とCD-ROMドライブを1台ぶっとばしました。どるこむでみなさんにアドバイスをもらったときにはもう遅かった・・・。
http://www.cham-reo.com/logsearch/archive/stage_3/pc-98/sled19672.html