ん〜，こう言う質問を見てて思うんですけど「これが限界です」ってのはきっちり線引きできるもんなのでしょうか（^^;）
色んなサイトや会議室を巡ってそこでの改造話や拡張話を拝見していると
・やりようによってはどこまでも
・「ここが限度です」と言うラインは思ってるよりあやふやで流動的
・・・と言う抽象的なイメージがわいてくるんですが．

２．のみですがIODATA製UIDE-98、UIDE-66または、IDE-98を 使用することによって32GB(理論値)認識可能だそうですよ。
http://www6.freeweb.ne.jp/computer/senri98/9801_pc9.html
あと、ディスク容量を増やすだけなら、ＳＣＳＩを併用すれば
いまでも十分通用する量にはなるんじゃないでしょうか。
速度のほうは・・・・Ｃバスのだと遅いですからねぇ。

確かにEpion【HermesII】 さんのおっしゃる通りですね、現状での
限界と言われましても本人の知識や技術でも結果は全く別物ですし。

ご質問の殆どはこの掲示板の過去ログ検索（チャム＆レオさん提供）で
解ることばかりですので一度使って見てはいかがでしょうか。
http://www.cham-reo.com/logsearch/
キーワードはＶ１３、ＨＤＤなどそのものずばりで出てきます。

これだけではあんまりですので解る範囲で簡単に書いておきます。
１．Ｖ１３用でメーカーが保証する商品としてメルコより
　　HK6-MS600P-NV4(Ｋ６−III＋５５０MHz) 　
　　HK6-MD533P-NV4(Ｋ６−II＋５３３MHz) 　
　　HK6-MS400-N2(Ｋ６−III４００MHz) 　
　　等があります。市販（バルク品）の下駄やＣＰＵを使って
　　同様のパワーアップをするよりは割高ですが安心です。

２．元々の８５０ＭＢを４．３ＧＢの物に換装することは可能です、私は以前
　　Ｖ１３では無くＸａ１０ですが一時期４．３ＧＢｘ３台＋ＣＤ−ＲＯＭ
　　と言う状況で使っていました。

３．ＤＯＳでの使用（認識）が不要ならば選択肢も色々ありますが
　　とりあえずこちらもメルコから正式対応品として出ています。
　　CDRW-I4432FB

４．ディスプレイの仕様ではなくディスプレイアダプタ（グラフィックボード）
　　の仕様ですね同ボードの増設が必要です。
　　グラフィックボードはＰＣ−９８正式対応の物以外動かないと思った方が
　　無難です。

５．どのようなゲームか解りませんが一般的な答えとしては４．と併せて
　　メモリの増設が必須です、場合によってはＣＰＵもですが、、、。　　

６．ＵＳＢボードを増設して下さい、Ｉ・Ｏやメルコなど複数のメーカーより
　　ＵＳＢボードが出ています。ただしＵＳＢ機器の殆どはＰＣ−９８２１に
　　正式対応しておりませんので使える保証は有りません。

Ｖ１３では基本的ににＰＣＩが１スロットしか有りませんのでパワーアップの
手段は限られます、一部にはＰＣＩが２スロット有る機体も有るようですが
この場合は多少選択が広がります。
おきたさんの場合まずはメモリの増設からでしょうか、少なくとも９６ＭＢ
ぐらい有ったほうが良いと思います。

A1) HK6-MS600P-NV4。
A2) 4.3GBx2 を内蔵可能、IFC-NN を使い外付けＨＤＤを増設すれば 32GB も接続可能。
A3) 可能。（過去ログを調べてみてください）
A4) グラフィックボードの増設が必須。
A5) どのようなゲームなのか不明なため回答不能。最良選択肢は GA-VDB16/PCI です（入手困難）
A6) PCI の USB 増設ボードと Win98 以降の OS が必須。

これくらい書けばよろしいでしょうか？

早速の返信ありがとうございますm(_ _)m。抽象的な質問で大変失礼したにもかかわらず具体的なご回答感激です。是非参考にさせていただきます。HDDが、32GBまで認識可能だなんて凄く嬉しいです。どういうわけか、家のパソコンにはＰＣＩが２スロット有ります。これは選択肢が広がったと喜んでいいのですね。
まずはメモリの増設からやってみます。ありがとうございました。

うーん、それぞれの拡張方法は皆さんの書き込まれた通りなのですが、
お手持ちのマシンにはPCIスロットは１つしかないので
ＨＤＤ、グラフィック、ＵＳＢのうち何れか１つしか拡張出来ません。
（ＰＣＩが２つというのは一方がケースに出口だけがないということですか？）
手持ちのマシンを大切にするのは素晴らしいことですが、希望されている
ようなスペックにするのは不可能ですので、新しいパソコンを買った方が
宜しいかと思います。
今は１０万円でＣＤ／Ｒ付きのパソコンが買えますし。

あと、拡張の手間及びコスト、今後のサポート有無を考えると積極的には
お勧め出来ません。私の場合は既に目的に適合したスペックに拡張してあるので
今後も使い続けますが。
関係ないけどMD5500は心惹かれる、宝くじにでも当たったらきっと買うでしょう。
因みに今はMD1000これでも特に不満ないです。

＞ＨＤＤ、グラフィック、ＵＳＢのうち何れか１つしか拡張出来ません。

Win上であればHDDは本体I/Fのままで20GBまで対応している製品がメルコより販売されていますしCバスでも1台32GBまで対応している製品はありますから1つしか拡張出来ないと言う事はないですね。
HDDとGAもしくはUSBとなるかと、、PCIに隠しスロットがあるなら筐体加工してCHANPONボード付けてボードの機能が全て使えたなら+GAでSCSIなストレージ(含むIDE変換)もUSBも100BASE-TXなLANもGAも全て賄えますがトラブル回避能力が無いとツライですね、、
PCIバスが2つでしたら(内一つは外にカバーが無い状態そちらの)PCIスロットにUIDE-98(M)かUIDE-66を接続してHDDやCD-ROMを接続し、もう一つの方には98対応のGAで使用目的にあった物を接続すると快適度は増すでしょう。

ただ、拡張して10万超えるようならひしさんの書かれているようにPC/AT互換機も視野に入れた方が良いかも知れません。
でも10万のPCでは中途半端な性能であったり拡張性も乏しかったりしますので次回パワーアップ時に同じジレンマに陥り再度本体買い替えになる事もありますから選択は慎重にどうぞ、、

#私は98の改造が楽しいので何十万(何百万か？)と浪費して98を複数所有して
#CD-R焼き専用機やネット専用機、DVD専用機、TVやキャプチャー専用機(一部
#重複あり)として使っていますから98で不便は無かったりします。
#最近は98も安いですから複数のPCで環境構築するのも何かと便利ですよ。

V13に愛があるならいくらでもつぎ込もう。
愛がないならとっとと売り払ってATクローン機を買いましょう。

これにつきるかと。

まぁ、AT機なら最新型ですし自分で作る事も出来ますが、PC98でしか味わえないパワーアップの感じ方もありますし（自作機やブランド機にもそれぞれ味はありますが。）安定度も高いですよね。V13を力の限り使うならUP用途を決めて投資をしましょう。

隠しＰＣＩがあったとしても費用対効果で悩むとこでしょうね。
全て現行製品・実売価格（量販店のものなのでもっと安い店もあるでしょう）で書くと、
ＡＴＡ　Ｉ／Ｆ：Ｉ．Ｏ．ＤＡＴＡ　ＵＩＤＥ−６６　￥８，５００
Ｇ／Ａ：Ｉ．Ｏ．ＤＡＴＡ　ＧＡ−Ｓ２Ｋ３２／ＰＣＩ　￥２６，０００
ＨＤＤ：ＩＢＭ　ＤＴＬＡ−３０７０３０　￥１４，０００
ＣＤ−Ｒ／ＲＷ：ＡＴＡＰＩ　ＣＤ−Ｒ／ＲＷ　￥８，０００〜
メモリ（ノーブランド）：F.P.DRAM,60ns,パリ無し,32MB*4　￥１０，０００程度
ＣＰＵ：メルコ　ＨＫ６−ＭＳ６００Ｐ−ＮＶ４　￥３４，８００（一部店舗のみ）

といったところでしょう。安い新品パソコンなら買えてしまいますし、ベースクロックが６６ＭＨｚであること、チップセットがＷｉｌｄｃａｔであることも考慮すると、愛がないとつらいですね。（９８ファンとしては不本意ですが。）
因みに僕なら・・・上記を決行します(笑)
例）先日入手したＸａ７ｅ（メモリ、ＨＤ無し）
ＣＰＵ：ＨＫ６−ＭＤ５３３−Ｎ４
ＲＡＭ：FPパリ無し32MB*2+EDO(ECC)16MB*2（Ｘｖ２０純正：保証外）
ＨＤＤ：ＦＩＲＥＢＡＬＬ　ＳＴ４．３Ｓ
Ｇ／Ａ：Ｘｖ２０純正ミレ
ＳＣＳＩ：ＩＦＣ−ＵＰ外部コネクタもぎとり(笑)
ＣＤ−ＲＯＭ：ＳＣＳＩ　内蔵
ＰＣＩスロット増設

なんてことをしてます。

PC/AT互換機じゃなくても希望スペックに近い98もありますね。
V200M7C(DEFも)はソケ7の上限まで、HDDは残念ながら4.3GBの壁有り(上記メルコ製HDDやI/Fの追加で突破可能)、CD-R装備、GAはMGA-1064SG4MBなのでXGAでのフルカラー可能、USB装備、ゲームは最近の3Dゲームはどれも98ではつらいですが、、