ちょっとこれだけでは状況が…。
まず、FDDから立ち上げはできますでしょうか？
次に今動いているwin98から、エキスプローラーか何かでFDDを読みに行くだけでリセットされるのでしょうか？
確認はされていると思うのですが、PC/AT機用のFDということは無いですよね。

Ｘａ７初期付属のＦＤＤです。また、ＦＤＤを入れたまま起動すると当然ＦＤＤのブート順位が一番高いためにＦＤを読みにいくのですが、このとき一度読んだだけですぐリセットがかかります。
故にスイッチオン・・＞メモリーチェック・・＞ＦＤりーど・・＞リセット・・＞メモリーチェック・・＞ＦＤりーど・・＞リセット・・＞以下ループ
となってしまい、もう私としてはお手上げです。また、ＦＤを入れずにＨＤＤからの起動はうまくいきます。しかし、ＷＩｎ９８が起動してもＦＤを読みにいくとリセットがかかります。

ＰＣ－９８２１のＦＤＤのＢＩＯＳは強力過ぎて、エラーが発生した場合にＣｏｍｍａｎｄ．ｃｏｍを突き抜けてしまう場合があります。
私の所でも、ノートン先生のクラッシュガードも効かずにリセットしてしまう場合があります。
問題は、フロッピーが不良でそのトラブルならば、フロッピーを交換するだけでＯＫなのですが…
ドライブの不良が原因だと、ドライブ交換しか回避方法は無い事になってしまいます。
でも、ＦＤＤのトラブルでリセットの場合には、数十秒のリトライ繰り返しの結果でリセットになるはずですが…
ＦＤＤを読みに行って即時にリセットだとすると、何か別の原因、たとえば割り込みのテーブルが飛んでいるとか、ＢＩＯＳのデータが飛んでいるとか、の可能性もあります。

なにやらとても大変なことになってそうですね。(TT)
このような状態の場合、どうすればいいのでしょうか？

CPU交換はしてますか？ CPU変えてからFDDをつかえてましたか？
元のCPUに戻してFDDが使えるならCPU交換によるタイミングのズレだとおもいます。
自分もXa１０/Ｃで起こりました。その時は１１８ボードを差すことにより治りました。
ほかのボードでもいいのか試してませんが

　Xa**の一部でこの症状が出るらしいです。FDD自体は問題ないです。もしかしてCPUは、P54C-200か166だったりしていませんか？

どうも、ぜふぃみあです。
確かにＷｉｎｃｈｉｐ　Ｃ６－２００ＭＨｚに交換したら直りました。
みなさんの迅速なレスポンスをありがとうございます＜（＿＿）＞
しかし奇妙なのは今までふつうに使えていたＣＰＵを乗せて、なぜ使えなくなってしまったのかということです。

　P54C CPUの裏側に、SSSでなくVSSとかVSUと書かれている場合に起こるようです。Xa7は SSSタイプが載ることを前提に設計されています。

P-54CSは、Xa7の発売当時には出ていませんでしたからね・・・。
意外な盲点かもしれません。