同じ規格（設計）の物でしたら、９８もＤＯＳ／Ｖもありません。
単に、「９８に使われていた」というだけに過ぎません。
ただし、ＰＣ−９８２１に使われていたメモリーは、大抵は古い型式が多いです。
現在売られているマザーでは、そんな古い物を使用する設計になっていないはずです。
もちろん、例外もあるでしょうけど。
ＣＰＵも同様です。
たとえば今、新品で売られているマザーでは、ノーマルＰｅｎｔｉｕｍの１２０Ｍを使用するマザーなんか無いも同然でしよう。
ＰＣ−９８２だ１と、Ｘａ１２でもＶ１２でも、使われていたＣＰＵなんですけどねぇ。

逆に、くにさんの９８の型番により、流用が可能な場合もあります。
特にSocket7でSIMMスロットを搭載しているマザー(AX59?)では流用できる可能性が非常に高いです。

ある程度の制限は付きますが、充分に出来ます。PentiumやK6はSocket7マザーボードを使えば流用できますし、TekramのP5MVP-A4を使えばSIMMスロットが四つあるので、ベースを100MHzに設定してもメモリだけ66MHzで動かしSIMMの流用もできます。

GAに関しては、I-O DATAの98専用ViRGE系GAは使えることが多いですが、DirectDraw関連で画面にゴミが出ることがあります、MelcoのWGP-FXNはメーカーのドライバが使えずにリファレンスドライバを使わなければならなくなるそうです。
これら以外だと98/AT両用なので問題ないと思います。

皆さんありがとうございます！
ちなみに僕のマシンは次のようになっているのですけど、マザーボードの変更は出来るでしょうか。
ＰＣ９８２１　Ｖ１６６modelD
CPU I・O DATA PK-K6H400/98 400MHz
メモリ　DIMM用は買った当時のメモリを使用　
　　　　SIMM用　BUFFALO　EMHメモリ　計９６MB
HDD　BUFFALO　IDE-HDD　DBI-N4.3GT
グラフィックボード　BUFFALO　WGP-SFPN　３２MB
LANボード　BUFFALO　PCIバス　LGY-PCI-TR
CD-R　NEC　PC-MCDR220AD　

他、FDやディスプレイは買った当時のままです。
これでも大丈夫でしょうか？
また、どんなマザーボードがお勧めですか？
なるべくPCIスロットが多いのが欲しいのですが・・・

ＰＣ−９８２１は、ＤＯＳ／Ｖとは微妙に違うアーキティクチャの上に成り立っているものですので、マザーボードを交換した時点で既にＰＣ−９８２１ではなくなってしまいます。
従って技術的困難さを考えたら、素直にＤＯＳ／Ｖのケースを買ってきて新しいマザーボードを取り付けた方が良いのではないでしょうか？（もちろんＰＣ−９８２１の筐体にＤＯＳ／Ｖのマザーボードを乗せた例がないとは言いませんが。）
その上で、ＰＣ−９８２１に付いていたパーツをどれくらい転用できるかご質問されるのが良かろうと思います。
ちなみにこの様なご質問に適するのは、ＰＣ／ＡＴ掲示板だと考えますが。
この掲示板は、あくまでＰＣ−９８２１のアーキティクチャを愛し何とか使い続けていくことを目的とした情報交換の場なのですから。

JINさんご忠告ありがとうございます。
しかし、僕はDOS/VマシンにしたいのではなくあくまでもPC98マシンとして使いたいわけで
用はPC98として動くマザーボードが欲しいわけです。
現在のマザーボードはPCIスロットが２つしかなく、しかもずべて使っているため
HDDの増設が４．３Gの物しか出来ないのです。
V166ModelC2/D2以降のPC9821には４．３G以上のを載せられるそうですが。
だから、HDDが４．３G以上使えるマザーボードが欲しいわけです。

98として動くマザーがあったらたぶんみんな欲しいです。
今のDOS/Vのマザーと同じ性能のものがあるんであったら・・・
だから、パワーアップのできるマザーボードを搭載したマシンを中古で買って、パーツのうつしかえをしちゃうんだよなあ。

ご質問の意味を誤解していたようで、申し訳ありません。
しかしながら、ＰＣ−９８２１のマザーボードとなるとジャンクでのの購入か、古い筐体を中古で購入してばらすしか方法の無いことも事実です。新品マザーボードには、ＰＣ−９８アーキティクチャのものは皆無です。ちなみにＤＯＳ／ＶマザーをＰＣ−９８マザーに改造も一般的には困難と思います。（超絶技術のある方なら不可能を可能にしてしまうかもしれませんが）ジャンクでご希望にあったマザーボードを見つけることは相当困難と思いますが、それでもチャレンジしたいと言うことでしたら、お持ちの機種と互換性のあるサイズ、レイアウトのマザーボードを持ち８．４ＧまでのＨＤＤの使える機種は何かという風なご質問をされた方がよいでしょう。
従って、一番現実的な方法としては、ご希望に添うようなＰＣ−９８２１の中古を見つけて乗り換える事ではないでしょうか？
くにさんの夢に水を差すような言い方になってしまいました。お気を悪くされましたら、謝ります。おなじＰＣ−９８を愛するものとして他意はありませんのでご容赦下さい。

今見たら、マニアックスに別の切り口での質問をされてますね。
こういうのも重複投稿と言っていいのか？
どういうことがしたいのかきちんとまとめて、一つにまとめられた方がよいと思いますよ。

なるほど、そういうことでしたか。
しかしV166というのは98としては最高峰の一つですから、これ以上の性能を持ったマザーボードは存在しません。強いて言えばV200やV233のタワー型ですが、確かSIMMが使えないと思ったし、いくらなんでも買い換えの対象としては投資効率が悪すぎます。

で、見たらLANがPCIじゃないですか。LGY-PCI-TRというのは10BASE-TのLANボードですな。これをC-BusのLANカードに換えてPCIを節約すれば良いのではないですか。C-BusのLANは今となっては高いので金はかかりますが。

＞V200やV233のタワー型ですが、確かSIMMが使えないと思ったし、
使えますよ

あ、タワーはSIMMが使えましたか。なんかのモデルはDIMMしかないと思ったのですが、タワー型ではなかったようで、失礼しました。

＞C-BusのLANは今となっては高いので金はかかりますが。
どれくらいかと思って現行品を調べてみれば、
メルコ社・・9800円、ＩＯ社・・10000円。うげ〜。
ジャンク品でよければ中古・ジャンクショップを回れば500円くらいでごろごろ転がっていますが、釧路ではそんな店もないでしょうね。(^_^;)
CKK さん　が薦められているように、ＰＣＩ空けるためならＬＡＮカードを買ってもいいというのでしたら、
有りそうなところとしてはマップの通販か、
バスタグ　　http://www.bustag.co.jp/
で中古を探してみてはいかがでしょうか?
ジャンクは不動作な可能性が有るので、なるべくドライバーが入手可能なように形式が分かっていて動作保証付きのものをお勧めします。
それにしても、純正品とＩＯ・メルコ製でこれだけ固めてあれば、
ちょっとＡＴ互換機へは移れませんねえ。