HK6-MS333N2000はK6-III333Mhzで、
PK-K6H400/98はK6-2 400Mhzです。
よほどの限定用途ではない限り、爆速L2キャッシュの分、
全体的にK6-IIIの方が速いと思います。
そのままHK6-MS333N2000を使うことをおすすめします。

PK-K6HX400(又は/98)ならK6-III400Mhzだったのですが(^^;)

ありがとうございました。
マシンにつけて，ベンチソフトで測りました。
★ ★ ★ HDBENCH Ver 3.22 (C)EP82改/かず ★ ★ ★
M/B Name
Processor AMD K6-III 331.99MHz[AuthenticAMD family 5 model 9 step 1]
Cache L1_Data:[32K] L1_Instruction:[32K] L2:[256K]
Name String AMD-K6(tm) 3D+ Processor
VideoCard スタンダード ディスプレイ アダプタ (9821 シリーズ)PC-9821 MGA-1064SG (Matrox)
Resolution 1024x768 (16Bit color)
Memory 129,408 KByte
OS Windows 98 4.10 (Build: 1998)
Date 2001/01/05 23:53
SCSI = MELCO PCI SCSI IFC-DP
HDC = スタンダード IDE ハード ディスク コントローラ
A = GENERIC IDE DISK TYPE00
B = GENERIC NEC FLOPPY DISK
C = Virtual CD-ROM Drive
Q = MATSHITA CD-ROM CR-583 Rev 1.06

ALL Integer Float MemoryR MemoryW MemoryRW DirectDraw
5097 15915 10163 6259 2763 5525 2

Rectangle Text Ellipse BitBlt Read Write Copy Drive
10125 18710 6596 12 2848 2769 915 A:20MB

★ ★ ★ HDBENCH Ver 3.22 (C)EP82改/かず ★ ★ ★
M/B Name
Processor AMD K6-2 398.46MHz[AuthenticAMD family 5 model 8 step C]
Cache L1_Data:[32K] L1_Instruction:[32K]
Name String AMD-K6(tm) 3D processor
VideoCard スタンダード ディスプレイ アダプタ (9821 シリーズ)PC-9821 MGA-1064SG (Matrox)
Resolution 1024x768 (16Bit color)
Memory 129,408 KByte
OS Windows 98 4.10 (Build: 1998)
Date 2001/01/06 00:09

SCSI = MELCO PCI SCSI IFC-DP
HDC = スタンダード IDE ハード ディスク コントローラ

A = GENERIC IDE DISK TYPE00
B = GENERIC NEC FLOPPY DISK
C = Virtual CD-ROM Drive
Q = MATSHITA CD-ROM CR-583 Rev 1.06

ALL Integer Float MemoryR MemoryW MemoryRW DirectDraw
5293 19032 12156 6236 3787 5421 3

Rectangle Text Ellipse BitBlt Read Write Copy Drive
9173 17129 6116 12 2775 2744 950 A:20MB
激しい変化はなかったようです。
PSPICEなどをつかっていますので，スピード速いPK-K6H400/98を入れました。

HDBENCHではK6-IIIのL2の効果はほとんど見えません。
GAがVoodooBansheeでないなら，ほとんど見えないはず。
総合力を考えても，MS333-N2000の方が速いです。

PK-K6H400/98はどうあがいても400MHz止まりですが
MS333だとディップスイッチ1個動かすだけで366MHzで動く可能性があります。