HDD選択メニューが出ない件ですが、起動中のHDDを読みに行くまでの間にTABを押しっぱなしにして、
ピピピというBeep音がなり始めたらはなしてください。おそらくメニューが出てくると思います。
ここでWin2kが自動起動に設定されているので、解除してやれば次回以降メニューが出てくるようになります。
ちなみにNTをセットアップ時にも同じように自動起動が設定されます。

フリーズの件ですが、画面のメッセージがどうなっているのかできるだけ具体的に書かないと、みなさんアドバイスのしようがないですよ。
(ex. STOPエラーが出て「ブートデバイスにアクセスできない」と行った趣旨のメッセージが英語で出ているなど)
あと、HDD1、HDD2となってますが、SCSIは混ざっているのか、IDE UIDE-98接続なのかも重要です。
Win2kはNTと同じくSCSIボードやUIDE-98ドライバが用意されていない場合、HDDをアクセスすらできずお手上げになってしまいます。
この辺はMS-DOSモードでのアクセスができるWin9xとは違うので要注意です。

SilverStar さん。レスありがとうございます。

＞フリーズの件ですが、画面のメッセージがどうなっているのかできるだけ具体的に書かないと、みなさんアドバイスのしようがないですよ

これは、うっかりです。なにも表示されず黒い画面で停止。

＞あと、HDD1、HDD2となってますが、SCSIは混ざっているのか、IDE UIDE-98接続なのかも重要です。

おっと、これもうっかり。
すべて、標準のＩＤＥです。

追加です。

昔に買ったＮＥＣのＤＯＳ６でＡドライブを初期化してＨＤＤ選択メニューをＮＥＣ制に変更したら無事起動できました。
ＥＰＳＯＮ版は最近対応できなくなってきましたね。

ひょっとしてEPSONのHDDメニュー使ってたんですか？

Win2kではないんですが、NEC製でないHDDメニューを使っていて起動できなかったケースというのは私も遭遇したことがあります。

こういった掲示板では現物が手元にない以上投稿者の文章を元にレスをつけていくわけですから
情報は多ければ多いほど的確なアドバイスが得られる可能性が高くなります。
情報不足で解決できなかったらお互いが不幸です。
特に大多数のセットアップに成功している（と思われる）ユーザーと違う環境で使用している場合、
絶対にそのことを書いておいた方がよいです（それが原因である可能性が極めて高い）。

なんか説教臭くなってしまってごめんなさいね。
なにはともあれ起動できたそうで、なによりです。よかった、よかった。