あまりレスが付かないのも可哀相なので。。。

自分はそういったマルチブート環境が、ＮＴＯＳならできてしまうので
ツール類を使用したコトはほとんどないんですが
レスが付かないと言うコトは併用されておられる方がほとんどおられないか
それがどういうソフトで、どういう働きをするのか認識できているなら
同時に使っても大丈夫かどうか自ずと分かるであろうからではないかと想います

使ったコトがないので自分には分かりませんが
どちらも使い方次第で簡単にＨＤの中身を壊してしまいますので
迂闊にレスもできないのではないでしょうか

＃ゴミすまそ
＃キー：01123

レス遅くなりましたが・・・。
きつい言葉かもしれませんが、ご自分で一度試してみてはいかがでしょうか？

参考になるかどうかわかりませんが、以下は私の動作報告です。
ＭＢＭで領域作成後、パーティションマジックでの領域変更等を行うとうまくいく場合と
うまくいかない場合があるようです。私の場合はうまくいきませんでした。知り合いは運良く？うまくいったようです。
私の場合（自作機）は、ＭＢＭで領域作成→Windows98SEセットアップ→パーティションマジックインストール→パーティションマジックでの領域変更はできましたが（エラーメッセージ（内容はわすれました）が出てきます）、再起動すると２度と起動しなくなりました。