今、2000Serverを触れる環境がないので外しているかもしれません。ご了承下さい。
　昔Win2000のtelnetサーバの実験をした時に、認証レベルを4に落とさないとActive-
Directory下にないユーザからのリモート接続が出来ませんでした。
　ですので、ActiveDirectory下に作ったユーザのつもりで、実はそのサーバのローカル
ドメインに作成したユーザではないか確認してみてください。
　一番いいのはプライマリドメインコントローラのサーバで確認する事ですが…。

IIS5.0で構成されているのですね？そのユーザはDomain Usersに所属しているのですね？
グループをFTPオペレータに加えるのではなく、ユーザそのものを加えたらどうなりますか？
あと、サイトの設定で「匿名接続のみを許可する」は、はずしてみましたか？

かねやすさん、エクセリアさん、レスありがとうございます。
＞かねやすさん
実はプライマリドメインサーバしかないので、このサーバでしか確認できないのです。

＞エクセリアさん
ユーザそのものをFTPオペレータに加えてFTPサイトにログインしてみましたが、やっぱりパスワードが合わないと言ってはねられてしまいます。アドミニは問題なくログインが出来るのが気がかりです・・・
Annonymousについては「接続を許可する」チェック自体がはずれている（＝接続のみを許可するは当然グレー）のですが、それではまずいのでしょうか？

FTPクライアントはなにを使われてますか？
こちらでは標準のFTP.EXEを使って試してみたのですがうまくいっているようです。

サーバがDCに昇格した時に、ローカルログオンの権限がUsersグループから削除されます。
で、もう一度権限を付与してあげる必要があるのですが、２．でされているようにローカルセキュリティポリシーで操作しても反映されません。
DCで同様の操作を行う場合、ドメインコントローラセキュリティポリシーを使用する必要があるかと。

当方もDC上にFTPサーバを立てていますが、匿名、認証ユーザ両方がログインできます。
あと、認証レベル（LmCompatibilityLevel）は５でも問題ないですが、TELNETに関してはMSのJP233069にあるように、問題あるかもしれません・・・・

エクセリアさん、さかいさん、レスありがとうございます。
結論から申しますと、やっと問題なく認証が行われる事が出来ました。
問題となっていたのは
>DCで同様の操作を行う場合、ドメインコントローラセキュリティポリシーを使用する必要があるかと。
この記述で改めてドメインコントローラセキュリティポリシーを見直したところ、ローカルログインのところが”未定義”になっていました。これではadministrator以外でログオン白というのが無理と言う事でした。
>エクセリアさん
クライアントにはFFFTPを使いました。上記設定を実施後問題なくログインが出来るようになり、ソフトウエアの相性等ではなかったようです。表示をＵＮＩＸのように設定した為、端から見るとＵＮＩＸのＦＴＰサーバにしか見えないようです。（笑）
>さかいさん
的確なご指摘誠にありがとうございました。ＤＣなので当然ローカルセキュリティでなくＤＣセキュリティを使うのは当たり前ですよね。ぽっかりと抜けた穴が埋まったようでとても助かりました。これで自宅だけでなく会社のサーバに対しても認証ディレクトリの設定を進める事が出来ます。レスを付けて頂いた方々、本当にありがとうございました。