結局のところOSは何を使っていて、問題の出るデータは何のデータなんでしょうかねぇ。
肝心の情報がなさすぎなような。
またどのようなHDDをどのようなケースに入れて運用しているのかもさっぱりわかりませんねぇ。

文面から察するに、ソフトウェア的というよりはハードウェア的な問題なような気がします。
その外付けケースが保証付きの製品でしたら、製造メーカーのサポートに問い合わせてみるのも一つの方法ではないでしょうか。

＞iEEEにて
iEEE1394の事だと思いますがiEEE(アイトリプルイー)だけだと他に沢山の規格が存在しているので略さないようにしましょうね。
#製品名や機器の型番然り

データ化けの原因としてノイズなども考えられますから周辺にノイズ発生源が無いかどうかの確認とケーブルの質(長さや取りまわし)などのチェックでしょうかねぇ、、

バイザーさんが仰るようにハード的な問題も可能性ありだと思います。ですので、
＞内蔵型HDDに市販の外付けHDケースを購入してiEEEにて接続しております
ＫＯ１さんも仰ってますが、この辺のハードウェアの詳細（HDDやケースのメーカ・型番等）を開示した方が良いと思います。

ちなみに、前のスレッドはこれですね。
http://www.cham-reo.com/logsearch/archive/stage_3/windows/sled22898.html

自分もハードウェア的な問題でシステムを連続で破壊されて痛い目を見たことがありますので、不安定と思われる機械はメインのPCには使わない方が良いと思います。

その外付けＨＤＤはLavieC　LC600J以外には接続してないでしょうか？

ファイルキャッシュの書き込みに問題が起こっていることが考えられます。
ドライブへの遅延書き込みを禁止すると回避できる場合があります。

皆様,ご丁寧なご回答有難うございます。
確かに抜けていたところがありまして大変ご迷惑をおかけいたしました。
＞ばいざーさん、KO1さん、DONEさん、ぱんださん、PicoChanさん
　WIN98SE使用で,問題となるデータはすべてです。jpg,mpeg,mp3,mov等…。
確かMAXTOR7400rpm(？)の80GBです。箱はNOVACのもっとはい〜るハードディスクケース。
昨日メーカーに問い合わせてみたところ,iEEE1394のケーブルにおいて４PIN→６PIN変換コネクタに不良が確認されているそうです。そう言う訳で,変換しないコネクタを送って頂けるそうです。そういうものを店頭に出さずに、回収してほしかったです。とりあえず、失った約10GBのデータはあきらめるしかないですね…。
　HDDかケースかどちらが原因かわからなかったので,ここに質問させていただきましたが,ケース会社のほうで原因が見つかりましたので,ここに書いてくださった皆様には消化不良みたいな質問をしてしまい誠に申し訳ございませんでした。
　ちなみに電源の落とすタイミングなど、なにかありましたらおしえてください。

なるほど、ハードウェア的なトラブルだったわけですね。HDDはD740Xかしら。
件の変換コネクタで問題が解決するといいですね。

個人的には「変換ものにはトラブルがつきまとう」という認識でおりますので、大事なデータは絶対に入れません。
＃というか最近変換かましてストレージ使ってないなぁ・・・

>バイザーさん
変換ものにはトラブルがつきまとう
、この教訓を私も常に覚えておきたいと思います。
ケーブル交換と相成りましたが、実際これでよくなった！！！って安心は出来ないですよ。
一度(と言うか3度も)失った信用は、私の中でもなかなか払拭できないです。
”これまでと変わらないようでしたら返品ください”
って言っても,変わらない状況=HDDのファイルが化ける、ことが起きない限り、
まだ良くなっていないんだというネガティブな確認しか出来ませんからね。

とりあえず,有難うございました。