カードが変わると同じリフレッシュレート周波数でも表示される位置が変わります。
どんなモニターをお使いかはわかりませんがよほどのことがない限りメモリー機能があると思いますので２台のパソを１台目は７５Ｈｚ、２台目は８５Ｈｚという具合に異なったリフレッシュレートを設定しモニターに情報を覚えさせればいいと思いますが？

肝心な情報としてV166以外のPCの型番やGAの型番、使用しているモニターの型番が無いでは解決策は出てこないですよ？＜V166も型番は最後まで記入しましょう。
＞１台目は７５Ｈｚ、２台目は８５Ｈｚという具合に異なったリフレッシュレートを設定しモニターに情報を覚えさせればいいと
使用しているモニターがV166付属の物でXGAで使用しているならリフレッシュレート85Hzではモニターが壊れる危険性があります。
GAがサードパーティー製のものなら付属ツールで画面の位置を調節できる物もありますがV166のMGA-1064SG及び付属OS等にはそのような機能が付いたツールは無かったように思います・・・もう一方PCの環境や使用しているGAの情報がないのでこれ以上は何とも、、
以前使用していたツールがあり使用しているGA用ならそれを使って回避するのが妥当なのではないでしょうか?

もちろんお使いのモニターが使用される解像度でそれらの周波数に対応している場合のことですよ

みなさんありがとうございます。機種を書き忘れました。問題のPCはＶ１６６ですが、GAはmga-1064sgです。このＨＤは以前９８００ＢＸ４に入れていたもので、GAにioかメルコのＣバスボードを入れていました。そのボードドライバをインストールしたときに
プロパテイで画面の位置を変えたと思います。
ＫＯ１さんのお話ですと、このボードを付けて元に戻せば、とのはなしですがちょっとみあたりません。別な方法はないでしょうか。
書きながら考えてみたのですが、切り替え器は自作です。これがどうかしているのでしょうか。

まず、機種名はV166だけではなくその後のS5C3等まで含みます。
モニターの型番もありませんしGAも曖昧、もう一台のPCの型番もなし・・・せめて↑で指摘している事柄は書いて下さい。
何故そうした情報が必要なのかは解決策を得るのに必要だからです。
場合によって必要無い事もありますが最初の質問内容からでは詳細を類推するのには限度があるのです。

BX4に入れていたHDDをOSごとV166に移植している・・・ライセンスが問題無いものとしてお話しますが、MGA-1064SGのドライバを入れて使用している段階で恐らく画面の設定も無効です。
画面の位置を調節するツールはモニター側に作用しているのではなくGAに作用して表示範囲を変えているからです。
なのでCバスGAのツールは使えませんね。

そうするともう一台のPC側のGA用ツールで変更するか、それが出来ないならモニター側で調節するしかありません。
使用しているモニターが何なのか解からないですがモニターのメモリ機能の説明がマニュアルにありませんか？
無ければフッ素さんがお書きのように両PCの設定を変えるなどしてかち合わないようにしてみて変化があるかどうか確認してください。＜ズレていたら調節しそれが保持されるのかどうかです。
それで駄目ならモニターを2系統入力の物に変えるか別々に接続するか面倒でも切り替えるたびに調節するか・・・・となりますね。

シェアウェアの、パワーストリップあたりを試してみるのもありかも。

何度も申し訳ありません。自宅でアップしていないためにデータを出せなくて・・
１台目は9821xa10/k12+n3 cpuk62+ 550改 GAはメルコＷＧＰ−ＶＸ８です。
問題の２台目は　9821V166/S5D MMX225改　でGAは1064SGです。このディスプレー
設定はスタンダードモニター８００Ｘ６００です。特にドライバは入れてません。
デスプレーは古いのですが、FMV-DP84Z です。

切り替え器を通さないでもやはり２台目は右寄りと上下の広がりがダメでした。
ｄｏｓでは良いのですが、ｗｉｎ９５の状態ですとダメなのです。
そこでデスプレーのつまみを設定し立ち上げると、ｄｏｓではずれてますが、ｗｉｎでは問題なく表示されます。

そのままで１台目につなぎますと、もうｄｏｓからずれてまして、ｗｉｎもずれてます
やはり２台目のｗｉｎ９５だけが問題のようです。デスプレーが古いからなのでしょうか。デスプレーのマニュアルもありません。シェアウエアがあれば使ってみたい気もします。私は時々ｄｏｓも使いますので、２台共にｄｏｓもｗｉｎも１台のCRTで調整しないで使うということは欲の出し過ぎでしょうか。

＞設定はスタンダードモニター８００Ｘ６００です。特にドライバは入れてません。
OS標準のドライバを組んでいるわけですね。
であれば原因はそれもあります。
他のモニターのドライバを使うと解決する事もありますので試して見てはどうでしょう・・・・個人的な意見としては2系統入力のあるモニターに買い換えることをお勧めします。
切り替え機を使うよりも画質が向上しますし、、
PC-KM174辺りなら中古で5000円〜8000円くらいです。

#アルファベットや数字は全角半角、大文字小文字をきちんと整理して使用すると読みやすくなります。
#ここの過去ログ検索では大丈夫ですが、他ではきちんとしないと検索に引っかからない事もありますので、、
#型番や用語も同様です。
#k62+はK6-2+、n3はN3下駄、1064SGはMGA-1064SG、ｄｏｓはDOS、ｗｉｎはWin、
#デスプレーはディスプレイと言った具合(デスプレーでは「死の遊び」といった意味になります(汗、)
#が一般でよく使われている表記です。

KO1さん。みなさんありがとうございました。
ドライバを入れてみます。無理難題なことをお願いしまして申し訳ありません。
ありがとうございました。