OSとメモリ量はいいのですが、CPUが苦しそうですね。
んーでもVS.NET開発環境が動くにはギリギリといったところか・・。

折角手元にあるので、ちょっと試してみました。
PC-9821Rv20(PIIODP333MHz x2 ,384MB)　Win2000ServerSP2+SRP(IE5.01SP2+α)
Visual Studio .NET Professional(MSDN Deluxe Edition)

CD-ROM挿入後、setup.exeが起動し「Visual Studio .NET をお使いのコンピューターにインストールすることはできません。
　NEC PC-9800 シリーズのコンピューターはサポートされていません。終了するには〜」と
出てアウトでした(^^;。
また、インストーラーの実態はsetup.exeではなく、vs_setup.msiというファイルなのですが、
この中身をOrcaで覗いたところ、該当するエラーメッセージもなく、また実行時の9800チェックもないようなので
setup.exeで門前払いされてしまっている感じですね。

では試しにということで、vs_setup.msiからインストールして見ようとすると、今度は
「このインストレーション パッケージはWindows Installer サービスでインストールできません。
　新しいバージョンのWindows Installer サービスを含むWindows サービスパックをインストールする必要があります。」と出てこちらもダメでした。
＃「新しいバージョンのWindows Installer サービス」をMSのサイトで探しましたけど…(^^;;;。

ということで、やはりPC-98では通常インストールできないと考えた方が無難です(残念ですが…)。

最後に一般的な話として、
＞ＨＤＤ２０ＧＢ、メモリー１９６ＭＢでＷｉｎｄｏｗｓ２０００
＞ＣＰＵはＭＭＸの２３３ＭＨｚ
勿論、開発する内容にもよると思いますが、OS,HDDは問題ないとして
CPUのスペックが相当低く、実開発時には耐えられない感じがします(^^;。
あと、メモリ容量も正直、Win2000上で.NET系開発とかになると最低256MB以上は
あった方が何かと開発時には良いと思います(MSは128MB程度から推奨範囲(2000Pro/NT4)に書いていますけど)。
＃当然使い方次第ですけど、開発時には色々起動しながらやりますから…ね(^^;。

学校の授業で使う予定なので、多分あまり高度な事はしないと思います。メモリーも２５６ＭＢにしようと思えばできるのですが、インストール自体できないとなると、やはり新しいパソコンを買うしかないでしょうね。ＯｆｆｉｃｅＸＰの９８チェックを解除した方がおられましたが、その方でしたら、何かできませんでしょうか？

呼びました？（笑）
自分が持っていないものをどうにかする、ってのは無理ですし、購入予定も有りません。
ただ、DEN_EIさんの報告からすると、多分ディスクのどこかに、新しいバージョンのWindowsInstallerが入っているとは思いますがね。
OfficeXPをW2K以外に入れる場合がそうでしたから。