過去ログで調べてみたところこのトラブルの解決法には、
・レジストリエディタで「HKEY_USERS.DEFAULTControl PanelKeyboardInitialKeyboardIndicators」の値を2に変更する。（窓の手などで設定しても同じ）
・[CTRL]+[GRPH]+[VF5]を押してもう一度[VF5]を押すとNumLockがONになるのでこの状態でログオフしてみる。
の２つがあるようですがこの方法で直らなかった方もいるようです。ぼくもしばらくまえにいつも使っているWindows2000のアカウントでNumLockがOFFになってしまい困っていましたがプログラムを書くのにものすごく不便なので調査してみました。結果的には完全は状態にはできませんでしたが一応NumLockをONにすることには成功したので報告させてもらいます。

ぼくの場合「HKEY_CURRENT_USERControl PanelKeyboardInitialKeyboardIndicators」を2に変更しても再起動するとなぜか0に戻ってしまうというものでした。そこでregedt32で「HKEY_CURRENT_USERControl PanelKeyboard」を書き込み不可にしたところ一応NumLockがONの状態でログオンできるようになりました。しかしこの方法では残りの２つの値も変更不能になっているので他に不具合があるかも知れません。

どうしてもダメな方は試してみてはどうでしょうか？