PC-98掲示板かWindows掲示板で以前、PC-98でテンキーがカーソルキー動作してしまい
そこから復元したいというスレッドがあがってました。
私の方でもPC-9821Xv13/W16+Windows2000 Professional SP2という環境で同様の
症状になったのですが、下記の方法で解消することが出来ましたので、情報として
掲げておきます。

1.スクリーン キーボードを起動します。

　スタートメニュー→プログラム→アクセサリ→ユーザ補助　の中にあります。

2.スクリーン キーボードのテンキーの左上にある"nlk"キーを押します。
（PC/AT互換機でNumLockキーに相当）

3.メモ帳などを開き、テンキーから数字が入力できることを確認します。
　確認できたらスクリーン キーボードを終了します。

4.再起動し、テンキーがそのまま有効になっているかを再度確認します。
（私の方では有効になっておりました）

ユーザプロファイルの異常等の原因でいきなりNumLockが解除された状態（テンキーが
カーソルキーと同様の動作になる）になることがあります。
PC-98ではNumLockに相当するキーが搭載されておらず、何らかのショートカットキー
で切替が出来る物と予想されますが、そのキーがどれかわかりません。
NT4.0ではショートカットキーがあったのですがWindows2000ではキーが変更されている
ようです。
そのため、上記のような方法で行うのが一番わかりやすく、最善の方法だと思います

PC-98版のスクリーンキーボードもなぜかPC/AT互換機と同様の106キーボード配列
なのがアレですが（汗