下の方に書き込みがあったのでそれに関連して投稿させてもらいます。
ＮＴで４ＧＢ以上のＨＤＤにセットアップできるということです。
方法は
（用意するもの）
・WinNTインストールフロッピーのコピー（＃１のみで構わない）
・NT Service Pack4 (NEC PC98シリーズ用）
（手順）−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−
「１」インストールフロッピーをコピーする。
「２」SP4を展開し、次のファイルをインストールフロッピーに上書きする。
｜ ａｔａｐｉ．ｓｙｓ ｜
｜ ａｔｄｉｓｋ．ｓｙｓ ｜
｜ ｄｉｓｋ．ｓｙｓ ｜
｜ ｃｌａｓｓ２．ｓｙｓ ｜
「３」ＦＡＴ１６でフォーマットしインストールを実行する。
「４」フォーマットと最小パックがコピーされたら必ずエラーが出るので、
その前に手順２のファイルを
ｘ：Ｗｉｎｎｔ￥ｓｙｓｔｅｍ３２￥ｄｒｉｖｅｒｓ に上書きする。
「５」正常にインストールが続行されるのでそのままインストールを続ける
−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−
※ 以上のような修正をWinNT以外のOSから実行しなければならないので、
インストール時はNTFSを選択できない。MS社に嫌がられるかもしれないが
インストールディスク自体にこれらのファイルを組み込んで
CD-Rを作ったほうがいいかもしれません。
欠点はＦＡＴしか使えないのでＮＴＦＳにしたいときはあきらめるかＣＤ−Ｒ
で使うしかありません