要するにI/O関係の負荷が掛かるとMSGSRV32.EXEが内部で無限ループを起して
CPU負荷は上がり、応答もしなくなるという状態ですね。
メモリリークも起すことがあります。要するにバグです。
MSが修正するのはたぶん期待できないでしょう。
(そのほうが2000が売れますので)
根本的な対策はありませんが、負荷を減らすというのなら
http://www.tomoya.com/の山本式風水変造version 2001(Win-Meフォローアップ編
を読んで、フォント関係の負荷を減らすと良いかもしれません。