どうも、ぜふぃみあです。

現在、自作機でwindows2000(SP2)を入れて使用しているのですが、インストール直後は
ログインからすぐに操作可能になったのですが、いろいろとアプリケーションを入れていく内に
操作可能になるまでの時間が、異常に長くなりました。具体的には、スイッチオンからログイン
すると、画面にマウスの砂時計マークだけが表示され、そのままHDDにアクセスしていたり
していなかったりと、時間が過ぎ、２０秒ほどするとちゃんと画面が表示されて、いろいろと
スタート時に読み込まれるアプリケーションが読み込まれはじめ、操作ができるようになります。
一度この状態からログオフをし、再度ログインをしても、今度は画面は最初からでているのですが
マウスポインターは相変わらず砂時計のままで、結局操作が可能になるまでの時間は変わり
ませんでした。(T^T)

原因を調べるために、ログイン直後にctrl+alt+delを押して、何かにCPU時間が異常に
とられていないかどうか探したのですが、何かに異常にとられているということはありません
でした。ではログに何か異常が見られるのではないかと思ったのですが、これもなにも異常の
ログはとられていませんでした。途方に暮れ、ＭＳに電話をしたのですが、分からない、と
言われさらに途方に暮れました（笑）

さて、原因はAToKを入れたあたりからおかしくなったので、そのあたりだとは思うのですが
正確にどこから、というのが断定できません。
また、なぜ操作ができない時間が続くのかも分かりません。
このあたり、なにが原因とみられますでしょうか？

なお、自作機のスペック。インストール手順は以下の通りです。（なお、すべて定格動作です。）
CPU : Athlon 700MHz(Slot A)
mother : AOpen AK72
Mem : Bulk 512+128MB(PC133 CL=3)
GA : Creative GeForce Pro(AGP 32MB)
sound : Creative SBLive! Plutinum
Capture : GA-BCTV4(PCI)
HDD : DTLA(7200rpm 2MBcache seek 8.9msec ATA66)
DPTA(7200rpm 2MBcache seek unknown ATA66)
DVD : Creative PC-DVD6X(DMA mode)
NIC : Corega FEather PCI-FX(100/10Mbps)
GAME_IF : IF-SEGA(ISA)
FDD : Mitsumi 2mode
Key board : PS/2 and USB(Logitech)
mouse : PS/2 and USB optical
power suplly : unknown 300W
OS : windows2000 professional SP2

インストール手順
windows2000導入・・＞キーボードの102認識から１０６認識へ・・＞SP2適応
・・＞GA-BCTV win2000版導入・・＞IF-SEGA win2000導入・・＞レジストリのメモリ周りチューニング
・・＞DVDのドライブレター変更・・＞仮想メモリ場所変更・・＞AMD+VIAのAGPパッチ導入
・・＞回復コンソールの導入・・＞APMの導入・・＞スプール・tmpフォルダ設定
・・＞SC-8850,MU-2000,MN128-miniV導入（windows2000のUSBドライバ）
・・＞AToK導入・・＞SBLive! windows2000ドライバ導入・・＞LiveWare導入
　　　　↑このあたりだったはずなんですが・・・
・・＞JST導入・・＞現在