使用しているOSはwindows2000(SP1)です。

再度ATOK11をインストールし直してから、JUSTSYSTEMアプリケーションでアンインストールしてみてはどうですか？

>再度ATOK11をインストールし直してから〜
この方法は、一度試してみましたのですが
インストーラーに同様のエラーではねられました・・

まずAdministratorで起動して以下の設定をしてください。
コントロールパネル→管理ツール→コンピュータの管理→ローカルユーザーとグループ→
ユーザー→TAKASHIさんのユーザー名をクリック→*****のプロパティ→所属するグループ→
でグループにAdministratorを加えてください。
設定が終わりましたら、TAKASHIさんのユーザー名で再機動してください。
機動後ATOK11を削除し再び再起動すればどうでしょうか？

削除出来たのを確認後、あなたのユーザー名からAdministratorを切り離せば作業完了です。
（いまいち自信がもてませんが・・・・）

>”他のJUSTSYSTEMアプリケーション終了してから〜”
というメッセージのように、JUSTSYSTEM のアプリケーションが動作中です。

動作しているアプリケーションを終了させてから、再度 JUSTSYSTEM のアプリケーション追加と削除を
実行すれば宜しいかと思います。
JUSTSYSTEM のアプリケーション追加と削除は、同社アプリケーションが動作中だと実行出来ません。
# マニュアルにも記載されています。

一太郎を常駐させているとかありませんか？
常駐させているなら、タスクトレーにアイコンが表示されていると思いますので、そこから終了させて
ください。右クリックでメニューが出たような気がします。
うちは常駐させていないので忘れましたが・・・。(^^;

>Administratorで起動して以下の設定〜
はい、これもやってみました、常にAdministratorでログオンしているもので・・・（汗

>一太郎を常駐〜
それも確認しましたが、タスクトレイに常駐しているアプリなどは有りませんでした。

えーっと・・・先ほど、少々強引ですが、
何とか解決できたようなので、その方法をご報告します・・・

1,　”Administrator（権限を持つ）アカウント”でログオンし、
　　入力ロケールの標準をATOK11以外に変更する。

2,　レジストリエディタで
　”HKEY_LOCAL_MACHINESYSTEMCurrentControlSetControlKeyboard Layouts”
　　および”HKEY_LOCAL_MACHINESYSTEMControlSet***Keyboard Layouts”下の
　”ATOK11エントリを含むキー”を削除。

3,　Windowsフォルダ以下の”ATOK11*.*”ファイルを、適当な名前にリネーム。

4,　”JUST（初期設定）フォルダ”を適当な名前にリネームする。
　　（ATOK11フォルダではないのは、ほかにも原因があったため）

5,　再起動後、使用してみてシステム等に問題が無いようならリネームしたファイル（フォルダ）を、削除。

結局最後まで、同社製のアプリで何が動作していたのかは分からず終いでした（汗
この方法でも、標準はMS-IME2000に戻ってはくれませんでしたが
ATOK14をインストールできたため、今のところは事なきを得ています。

いろいろとレスをありがとうございます。

＞結局最後まで、同社製のアプリで何が動作していたのかは分からず終いでした
な〜んか気になりますね、もしかして動作してたのはATOK11だったりして？

タスクバーに有るATOK11のアイコンを右クリック→プロパティでMS-IME2000を標準に変更と、
アイコンを左クリックしてMS-IME2000に変更を同時に行いましたか？

>な〜んか気になりますね、もしかして動作してたのはATOK11だったりして？
確かに、その可能性大ですねぇ・・・
ほかのプログラム、ブラウザの表示プラグインが〜とか言うメッセージもでたのですが・・・
（ATOK14セットアップ時のエラー）
こっちの方が気になってしまいまして・・・

>タスクバーに有るATOK11のアイコンを右クリック→プロパティでMS-IME2000を標準に〜
ん・・・・これはもしかしたら、やっていないかもしれません・・・
通りで、表示（IMEの種類の）が矛盾していると思いました。