非常に難しい質問かな・・・言ってしまえば「本人が満足している
環境が快適に動く環境」です。
>いつも快適な環境でいたいです。
これは全ユーザの希望でありますが、実際はそうもいかないです（＾＾；
まあごく一般論的なWinを快適に動かす方法として、メモリ大盛り（で
きれば特盛りかあと少しでこぼれる位（＝メモリMAX)がよい）、CPUを
強化（この場合はK6-III化）、HDDの速度向上（UltraATA33/66対応か
UltraSCSI以上）、不要常駐物の解除、窓の手などを使って不用機能の
削除、メモリ最適化ソフト使用などがあります。しかし、これだけの
手を尽くしてもWin95/98だと長時間使いつづけると「快適な環境」か
ら次第に「不快適な環境」に落ちていくことがあります。まあ、その
あたりは了解して使うしかなさそうです。
NT4.0だと安定度はWin95/98に比べて大分高くなっているようなので、
どうしても安定環境が欲しいならこちらに移行するのも手です。ただ
し、遊べるゲームは限られます。

ちょっと補足ですが、私の説明では「快適度」は「安定度」に
比例することを前提にしています。いくら速く動いても動作不
安定なら快適ではありませんからね。

ウイルスチェッカーなどの常駐プログラムがあると，ユーザーの操作に関係なく遅くなりますね。

後は，常駐型ウイルスがすんでいるとかもひょっとしたら関係あるのでは？

自分の中の基準としては

・メモリが128MB積まれていること。
　(作業中のアプリだけはなるべくオンメモリ状態にしてスワップを発生させない)

・ハードディスクが「高速」なこと。空き容量も重要(スワップ状態からの脱出の速さ)

・レジストリが綺麗なこと
　(Windowsはレジトスリ情報を頻繁に読みに行きます。その時に余計な情報が入ってい　　て読み出し動作を妨げないように)

です。CPUやGAの速度は書かれていませんが重要度としては次点というカンジです。

ハードディスクの高速化はまだやってないのですが、体感速度ではやくなるそうですね。
今度やってみます。なぜかIME98で三つも常駐アプリがあるのですがこれは変ですか？
また、ATOK12と切り替えができるようになってるのですがこれも一つにした方がいいのですかね。
またレジストリは、ゲームのインストールやアンインストールなどで、決行余計なことが書かれていそうなので、消去したいと思いますが、
うまく消去する方法やフリーソフトかおすすめの本があったら教えて下さい。

私はWindows付属のレジストリエディタを起動し、
HKEY_CURRENT_USERSoftware
HKEY_LOCAL_MACHINESoftware
の中を定期的に漁っています。
ゲームなんかのセーブ情報は必ずどっちかに入っていると思うので
ゲーム名やブランド名で見てみるといいかも。

あとはノートンのWin Doctor任せです。（＾＾；

私の快適度は自分が使いたいソフトやハードが問題なく動作してくれることです。
なので、メモリが多いとかHDDが多いというのは２の次の話です。
メモリもHDDも多いことに越したことはないですが、きちんと動く方を優先させます。
いくらＯＳが優れても、使いたい物が動かないのでは意味ありませんので・・・
私がWindows98&2000を使うに当たり最低限必要な環境は次の通りです。
CPUはCeleron300A　メモリは64MB、HDDは6.4GB　CD-ROMは２０倍速　
とディスクトップ＆ノートに共通した環境です
デスクトップはＧＡはnVidia RIVA TNT２ULTRA　ディスプレーは１７インチ
ノートは、１４インチ　ＧＡはきちんと１４インチで１０２４×７６８をHighCollarで表示でき、動作に問題がないこと

＞あとはノートンのWin Doctor任せです。（＾＾；
実は私もお気に入りです。
レジストリの修復（不要な部分の切り捨て）は問題起きた記憶がありません。
早くWin２０００にもノートンを使えるようになればいいし、ＴＡ（INS MATE V-30DSU NTT Corporation）も対応して欲しいです。
なのでディスクトップは今だWin２０００オンリーに出来ないんです・・・

と言うことで参考程度にアップしてみました。

成る程、使い方しだいですよね。
私も仕事に使うコンピュータには、必要以外のソフトは入れないようにしています。
確実に動作しなきゃ意味ないですからね。
ですが、自宅のコンピューターはもはや趣味となってるので、
スピードを優先してしまいたい所があります。
OSは発売されてからしばらくたたないと分からない所があるので、車の最終モデルを買うみたいな気持ちで待ってます。

貴重な意見をありがとうございます。
ノートンはマックで動いているのを見ただけで、ウインドウズでは使ったことないのでちょっと調べてみます。

ノートンユーティリティーを使い慣れた方はこれがないとかなり不便ですよね。
スキャンディスクやデフラグがかなり速く終わるんですから・・・
これだけでも価値有りと思うし・・・

自分はレジストリ整理にRegcleanを使ってます。お気楽ですし何よりMSから無償で提供されているので(^^;