どなたもレスをつけられないようなので。
９８ＤＯＳ用のオンラインソフトならＶｅｃｔｏｒにまとめられています。
見つけにくいかもしれませんので貼っておきますね。
http://rd.vector.co.jp/vpack/filearea/dos/
おすすめと言えばメニューソフトのψ（プサイ）メニューですかね。
あとグラフィックローダーのＭＪＬぐらいかな。

98のDOS用フリーソフトで手放せないものと言えばやはりHSBですね。
http://www.vector.co.jp/soft/dos/util/se002233.html
初期設定がちょっと面倒ですが使い始めると超便利です。
(パーテンション指定で高速再起動したり複数のCONFIG.SYS,AUTOEXEC.BATの切り替え等)

他にも様々なプログラムがるのでvectorのサイトをさまよってみてください(笑)
DOSのソフトはここに集められているようです。
http://www.vector.co.jp/soft/dos/util/se002233.html
#数が多すぎて目的のソフトが見つけられないと言う話も(^^;;

あと、お勧めと言ってはなんですけど、個人的に面白かったので
http://www.vector.co.jp/soft/dos/util/se002233.html
ここの「うねうね(花火バージョン)」テキストエディタやファイル管理ツール
の裏で花火を打ち上げてくれます。(win9xのDOS窓は実行しない方がいいかも)

ちょっと訂正最後の部分の
誤：(win9xのDOS窓は実行しない方がいいかも)
正：(win9xのDOS窓では実行しない方がいいかも)
　　　　　　　　　↑↑

追伸：どるこむ仲間の掲示板!(通称どる仲)で話題をふってみるといいかも。
どるこむトップページの左の方にリンクがあります。
#相変わらず文章書くのが遅いなぁ〜＞自分

　う〜ん、HSBは私も勧めようかと思ったんですけど、「DOS/V版のない」という条件だったので、これはダメではないのかな〜？ とか・・・(^^;)

　で、私が手放せないモノというとVEM486ですかね。一度使ってしまうと、EMM386などというタコなメモリマネージャには戻れなくなること請け合いです。

うーん、98専用でお勧め…ならERCACHEとその補助ツール群はどうでしょう。
仮想フロッピードライブ機能、画面キャプチャなどなど痒いところに手が届くツールですよ。
私はVEM486とあわせて重宝してます。

HFというファイラもあります。
FDと違いグラフィカルなファイラです。
昔はフロッピーに入れて持ち歩いていました。

ＨＦ…いまだにＤＯＳでしかＣＧを描かない私は、まるぺとセットで常用してます。
ＯＳは窓９８ＳＥなんだがね（笑）
パソ通なんてものをいまだやってるなら、ＫＴＸ（もちＤＯＳ）とか言うのだが…。