憶測ですがパーティションが大きすぎる可能性があります。
私もあるゲームにて１ＧＢのＨＤＤにインストールしようとしたときＨＤＤの空きがありません。というエラーになったことがあります。

谷さん、早速のお返事有り難うございます！！
＞憶測ですがパーティションが大きすぎる可能性があります。
今から試してみます。
確かにＭＳ−ＤＯＳやＷｉｎｄｏｗｓにもパーティションの制限がありますし。
とりあえずＣドライブをいったん削除して、５００メガくらいに切り直してみます。

結果は後ほど・・・

>Ｄｉｓｋ１及びＤｉｓｋ２のデータをハードディスクに転送・解凍後
>起動ディスクにＭＳ−ＤＯＳのシステムファイルを書き込むのですが、
>そこで「システム領域の確保ができませんでした」とのメッセージが出て
>インストールが中断してしまいます。
つまり、HDDへのインストールまでは正常に行うことができているが
FDの起動ディスク作成に失敗しているという症状ですね。

>添付の起動ディスク内にあるＩＮＳＴＡＬＬ．ＥＸＥを起動
MS-DOSはFDから起動しているのでしょうか？
ご存知のように98は起動ドライブによってドライブレターが変化するので
FDの起動ディスクが必要なゲームではインストール時にFD起動しておかないと
上手くいかない場合があります。

外付けFDDを増設されているとのことですが、優先的に起動するドライブを
システムメニューで正しく選択してください。

MS-DOSの起動ディスクのconfigでシェルを指定していない場合は
インストール時のカレントディスクに常にio.sysを始めとするシステム一式がある
状態にしておいてください。
システム転送時にこれらのファイルがないとエラーが発生します。

私の思いつくのはこれくらいですが、お役に立てる出そうか？

結果のご報告に参りました。

まずは、ＫＥＴＡさん有り難うございます。

＞MS-DOSはFDから起動しているのでしょうか？
少し説明不足でした。
このソフトのインストール方法は、まずＨＤから起動し
任意のドライブに起動ＦＤを入れ、カレントドライブをそのＦＤＤにしてから
ＩＮＳＴＡＬＬ．ＥＸＥを起動するという流れなのです。
起動ＦＤにはそもそもＤＯＳのシステムファイルは入っていないので
インストール中にそれを転送しているようです。

それで結果ですが・・・・とりあえずなんとか動くようになりました。
原因はＤＯＳのバージョンと言ったら良いのか・・・・
少し長くなりますが、今後の参考のために（参考にならないでしょうが）書いておきます。

まず、元々の起動ＦＤにはＤＵＭＭＹ．０とＤＵＭＭＹ．１と言う６５５３５バイトのファイルがＦＤ内の先頭にあります。
おそらくこれをインストーラーがＤＯＳのシステムファイルと書き換えるのだと思うのですが、この２つのファイルの大きさが問題なのです。
ＤＯＳの起動に必要なファイルは
ＩＯ．ＳＹＳ、ＭＳＤＯＳ．ＳＹＳ、ＣＯＭＭＡＮＤ．ＣＯＭの３つですが、
ＩＯ．ＳＹＳは（私の知る限り）ＤＯＳのどのバージョンでも６５５３６バイトです。
しかし他の２つはバージョンによってファイルのサイズが異なります。
ちなみに
Ｖｅｒ６．２の場合　ＭＳＤＯＳ．ＳＹＳ　　：３９６４４バイト
　　　　　　　　　　ＣＯＭＭＡＮＤ．ＣＯＭ：５４９８８バイト
Ｖｅｒ５．０の場合　ＭＳＤＯＳ．ＳＹＳ　　：３９６２０バイト
　　　　　　　　　　ＣＯＭＭＡＮＤ．ＣＯＭ：４８４０２バイト
Ｖｅｒ３．３の場合　ＭＳＤＯＳ．ＳＹＳ　　：２９６９６バイト
　　　　　　　　　　ＣＯＭＭＡＮＤ．ＣＯＭ：２４９３１バイト
でした。
以上のことから５．０以降のバージョンの場合、システム用の領域が
足りなくなってしまうようです。
試しにＤＯＳ３．３Ｄがインストールされているパソコン（ＰＣ９８０１ＲＸ２）に
インストールしたところ全く問題なくインストールできました。
しかしこのパソコンでは２５６色表示ができないのと
Ａｐ３は搭載しているＨＤの関係でＤＯＳ３．３が動かないので
ちょっと無理矢理ですが、以下の方法により動かすことができました。

１　空のＦＤをＤＯＳ６．２で　／Ｓ　オプション付きでフォーマット
　　（このときボリュームラベルを元の起動ＦＤと同じ「SC2起動」にしておく）
２　元の起動ＦＤからＤＵＭＭＹ．×のファイル以外をフォーマット済みのＦＤにコピー
３　２でできたＦＤ内のシステムファイルを削除
４　再度起動ＦＤから今度はＤＵＭＭＹ．×の２つを３のＦＤにコピー
　　（これでＦＤの先頭にＤＵＭＭＹ．×の２つがある状態になる）
５　４のＦＤでＰＣ９８ＲＸ２のＤＯＳ３．３がインストールされている領域にインストール
６　５でインストールした先にｓｃ２０００．ｃｆｇが作成されているので、それを適当な
　ＦＤに保存
７　９８２１Ａｐ３のＤＯＳ６．２の領域に普通にインストール
　　（この時点では途中でインストールが中断する。）
８　７でインストールした先に６で保存したファイルをコピー
９　４で作成した起動ＦＤのコピーにＤＯＳ６．２のシステムファイルを転送（コピーも可）

これで９の起動ＦＤから立ち上げメーカーのロゴが出たら、元の起動ＦＤと差し替えて
あげると（プロテクトチェックがあるので）ちゃんと動きました。
８の段階で、ＨＤ内の起動ファイルからも起動できるのですが、
このソフトはＥＭＭ３８６に対応していないようなので、
ｃｏｎｆｉｇ．ｓｙｓを書き換える必要があります。
メルコやＩ−Ｏのメモリ管理ソフトには対応しているようですが。

正直言って既にＷｉｎ版も出ているので、ここまで頑張らなくてもとも思いましたが、
色々と勉強になったので、良しとします。（＾＾；

ご回答頂きましたお二方には、本当に有り難うございました。

それでは長くなりましたが、これで失礼いたします。

上の文章ですが、長くて他の方にご迷惑でしたら削除しますので
その場合はメールにてご連絡いただければと思います。＜管理人様