私はプラネックス社（LANなどで有名）のこれを使って、ホリの10ボタンPSパッドを使ってます。
http://www.planex.co.jp/product/usb/ps-mg2.htm
価格は一寸高めですが、店によっては4.7k程とお手頃な所もあります。
私は某PSソフトの連携目的でメモリカードリーダーも欲していた為これにしました。

最近のアプリケーションならDirectInputは当たり前のように対応しているので、認識に付いては全く問題ないかと思います。
ただ、PSコントローラの仕様上、
１ボタン：△
２ボタン：○
３ボタン：×
４ボタン：□
と言う割り振りになっている為（どの製品でもこうではないかと思われる）、ゲーム側でキーコンフィグがついていないとやり難くなってしまうソフトもあるかも。
PSのパッドは巷に結構豊富な種類があるので入手もしやすいと思います。

使ってるコントローラは最初にも言ったホリ製のファイティングコマンダー10Bですが、パッドに連射が付いているのでSTGとかでかなり便利です。
上面に6ボタン付いているので挌闘ゲーム系でも使いやすいです。
USBが付いてないPC-98はMSサイドワインダーを使っていましたが、個人的にもう手放せなくなりました。（＾＾；

>USBが付いてないPC-98はMSサイドワインダーを使っていましたが、個人的にもう手放せなくなりました。（＾＾；
同感ですなぁ。ついでにもう一つ買おうかと思ってたり（爆）スレッドに関係ないレスですみません。

SMART JOYPAD3ってのを使ってプレステのデュアルショックを接続しています。
http://www.sknet-web.co.jp/
アナログ入力やバイブレーションにも対応してるのが売りみたいです。お値段は多分４０００円〜４５００円くらいだと思います。

レスありがとうございます。先程下見（笑）に行ってきました。
やはりプレイステーション接続モノが結構あったのですが、家にはSaturnと
Dreamcastしかないんです（笑）。Saturnのパッドが一番使いやすいんです
けどね・・・

では、IO-DATAのIF-SEGAがいいでしょうね。
サターンのパッドならほぼなんでも接続可能です。
バーチャガンを接続すれば、PC用のガンシューティングなども楽しめます。
http://www.iodata.co.jp/products/video/ifsg2pci.htm