起動用にしないならfdiskとか使って領域を普通に作ってください
起動用にするならfdisk /mbrを最初にやってください

プライマリマスターにつないでbiosで認識してから起動ディスクで起動,fdisk /MBRですかね？（過去ログをご覧ください）ただし、データ等も飛ぶようです。（間違い、不足等、どなたかフォロー願います）

blackboxさん、ＳＹさんレスどうもです。９８のHDDの方は単に容量増やす為に挿したいので
起動用にはしませんが、その場合マスターに繋いでも大丈夫ですか？昨日友達にPC起動時に
自動的に新規のHDDが繋がってないかチェックするようにしてもらったのですが、その時にも
全く認識した気配がしないんです。友達がhdd持ってきた時はスレイブに繋いでたようなのですが。。あと認識していなくてもfdiskは可能なのでしょうか？fdiskもちょっと自信ないので不安なのですが。。

>あと認識していなくてもfdiskは可能なのでしょうか
ダメです（よね）。ケーブルの再確認（電源も）、ＨＤＤのジャンパースイッチの確認もしてください（シングルのジャンパー刺さってるとか）。biosによってはオートでも何か操作した物も有った気が・・・（右列の中位の項目？）←何ともいいかげんでごめんなさい。

そうですよね、何かよく考えたらマヌケな質問してしまったかも(^^;一応諸々の設定は確認してみました。ジャンパはcaviarの６ピンなので真中の二つでＯＫだったと思いますし。。もし違ってたらどなたかレスお願いします。ではこれからうろおぼえのfdiskやってみます(^^;

98で使っていたHDDは、AT機でそのまま認識することも、全く認識しないこともあります。
認識してくれない時は、SYさんのおっしゃるように、プライマリマスターでつないで、フロッピーで起動させて　fdisk /mbr をしてください。
AT機でつかっていたHDDならfdisk /mbr してもデータは消えないのですが、98で使っていたHDDをfdisk /mbr すると、データは消えます。

>ジャンパはcaviarの６ピンなので真中の二つでＯＫだったと思いますし
３−４でスレーブですね。
なお、５−６でマスター、５−３またはなしでシングルだったと思います。

fdiskをしてみたのですが、ちゃんと認識していて拡張領域の設定まで終わってディスクのチェックの所で０％と表示されたまま止まってしまいました。
10分ほどしても変わらないので一旦消したのですが。。
とりあえずもう一度試してみますが、原因知ってる方アドバイスお願いしますm(_　_)m

あとちょっと考えたのですが、追加するHDDはWIN95下で使用してた2GBのものなのでfat16を選択してみたのですが、これが原因になる事ってあるんでしょうか。ちなみに現行機ではWIN98SE下で15GBのHDDを２つのパーティションに分けて使っています。

> これが原因になる事ってあるんでしょうか。

以前、どういう使い方をしていたか（どんなパソコンに接続して、どんなOSで使っていたか）は、まったく関係ないです。
ちょっと前のHDDには相性がけっこうあるので、どうしてもだめならセカンダリの方に接続してみてください。