ATA33については最近の上位HDDでは既に転送速度が頭打ちになってます。実効は約23〜25M程度と思いますが一個で40Gを超えるような7200回転の物だと、それに近い、あるいは越える物があります。DPTAの7200モデルはそれに当たるかと思います。参考までに...
http://www.kk.iij4u.or.jp/~masashik/HDD.html勿論HDDの先頭の高速な部分だけでの話でしょうが。
ただし、BE6のATA66には良い印象を持っていません。IIの方は知りませんがノーマルBE6ではB'sレコーダーGOLD使用時に問題が出ました。と言ってもこれは直ってるかもしれませんが。
個人的にはPROMISEのATA66カードをオススメします。amgさんがおっしゃっているようにRAIDカードへの改造も安価に可能ですし、仮にRAIDを使わなくても単なるATA66ボードとして使用可能です(改造後でも)
マザーはPEN系のはよく解りませんがP3B-Fについては一昨日アキバに行ったときお店でGeForceとの相性が指摘されていました。GeForceを使うわけではないですが一応。