やってみた事
1通知領域の履歴をクリア
2スタートアップフォルダのファイルを試験的に削除
です。

私も似たような症状になりました。
一回ログオフして入りなおすと復活する状態。
で、ＳＰ２を上書きインストールしたら直りました。

ＫＡＭＥ＠九州さんレスありがとうございます。
SP2を2回ほど当てなおしてみましたが2回とも
最初に立ち上がった時は正常なのですが
再起動等一旦落としてからの（2回目以降の）
起動からは、表示が出なくなってしまいました。

XPpro SP1でも発生する症状です＜経験多
と言うか毎日起動時に真っ先にタスクバーを覗くのはデフォになってます

接続機器、大概はIDEやSCSI等のドライブ類を増やしたりした時に頻発してます
普段使わない外付けHDD(SCSI)の電源を入れた場合にはほぼ発生しますし
＃その場合は数度の再起動でも減ったまま
ソフトウェアやドライバ環境が変わって、普段見えているCD-ROMドライブの類が
一切認識されなかった場合の再起動後の再認識時でも発生しました＜昨日
VGAドライバの更新直後等でも発生しました
＃こういう場合は再起動すれば直る＜ログオフでは無い

なるべく少なくしたり、起動タイミングをずらせる物はずらし
安定した所で様子を見ながら使ってます
再表示が可能な物
ディスプレイアダプタのアイコン
タスクマネージャでアプリ終了→再度実行
アプリをダブルクリックすれば表示される物
等々の場合は諦めています

ＯＳをクリーンインストールした直後はさっぱり発生しなかった事
クリーンインストールする前の環境では毎回全て表示できなかった事
環境を変えた時に頻発する事を踏まえると
起動時の負荷が高まる(ロード等の処理が増える)と発生するのでは無いか、と思います

解決策は。。。。分かりません
答えにならなくて申し訳ないです
消極的な解決策ですが、ＯＳをクリーンインストールすると幸せになれると思います

http://homepage2.nifty.com/winfaq/wxp/trouble.html#1447
こんなことです

破壊神ＫＡＺさん・一言 さんレスありがとうございます。
やはり仕様みたいですね・・・ｗ
クリーンインストールは他にトラブルも起きてないので
仕事が暇になるまで様子をみます。

解決しました。少し消極的ですが・・・
ルーターとネットワークカメラがあるで、UPnPデバイスアイコンを表示する
にしてたのですが非表示にしたところ、通知領域のアイコンは全て表示
されました。
ルーターとネットワークカメラのアイコンは無くても別段差し支えないので
このまま使いたいと思います。
皆様ありがとうございました。