Ｖ３６ＬＡですよね？　一度ＢＩＯＳリセットすると良いかもしれません。
ＨＤＤをマスタースレーブテレコに付けたとき、ＯＳ起動まで30分かかったことがあります。

>ハードディスクから起動しないようです
「そんなこと…」と思われるかもしれませんが、IDEケーブルの接続を一応確認してみては？
#筐体開けた後、割とよくやるミスなんで…

V36LAなんですが、結構下駄と相性が激しいような気がします。
動作報告があがってる組み合わせでだめだった経験が何度か。
ひょっとすると今回もそれかもしれません。

#メーカー製マシンはコミュニティが分化してる所が多いので、FMV系のサイトで質問されたほうが、有効な答えが得られるかもしれませんね。
#こちらとか、こちらとか。
http://v3xla.hp.infoseek.co.jp/fmv/index.html
http://v3xla.hp.infoseek.co.jp/fmv/index.html

この手のＦＭＶは、電源が１４５Ｗぐらいで不安定になることもあります。
起動ＨＤＤからゲタの電源を分岐すると、電源不足？になっているのかもしれません。
ＣＤ−ＲＯＭドライブから分岐すると好結果になることも。
K6‐IIIで言われてることですが
「Advanced PIO Mode」の設定を「Disable」に設定してL2 Cache"をDisabledにしたりする方法も試してみては?

>「Advanced PIO Mode」の設定を「Disable」に
下記サイトでの事例ですね。
http://www.venus.dti.ne.jp/~phashim/fmv/k6-2ash.html
http://www.venus.dti.ne.jp/~phashim/fmv/k6-2ash.html
HDDとの相性もあるみたいですね。

L2 Cache_Disabledはオンダイキャッシュの無いK6-2では問題ないんじゃないですかね?
#DECのCelebrisFXはK6-2使ってもこれやらんと駄目らしい(ってゆーか、駄目でした)ですが…

どうもいろいろやってみたのですか、うまくありませんね。
ハードディスクとの相性かも知れませんが・・・。

やっと動作しました。
原因はAdvancded PIO modeを無効にしないといけなかったのです。
メルコのＨＫ６シリーズと同様ですね。
どうもありがとうございました。