WIN2000はマザボ交換の場合、基本的に再インストールが必要になります。フォーマットはしなくても使えますが精神安定上システムドライブだけでもフォーマットしたほうがよいでしょう。さっぱりしますよ。

私もサブマシンをももさんとほぼ同様の環境からKT333とAthlon-XPへと交換しましたが、
一度さっぱりと一から入れなおそうと思いました。理由としては、やはりCPUやマザーを
交換する事によって確かに体感速度は上がりますが、きちんとHDDなどのストレージ系の
速度アップをしてあげないと十分な体感速度アップの伸びを体感できないかも・・と思ったからです。
と言う事でどうせ再インストールする気が有るんだったら。。と思っておニューなHDDを導入しました。
おニューな高速HDDを導入する事によってより体感速度の向上を感じる事ができると思いますし
古いHDDを残せる事によってより確実にファイルを残せて良かったと思いました。

＞MBを変更した場合、HDDは一度フォーマットしないと使えないですよね？

フォーマットを勧めましたが、必ずしもする必要性というのは無いと思います。
私もフォーマット無しで継続使用したり、上書きインストールだけでしのいだ事は
幾度ともなくありました。ですが、OSをきれいさっぱりにする事によって多少安定度
も向上すると思われますし、大幅なパワーアップに伴って一度環境を一新してみるのが
いいかなぁ・・？と思います。　(^-^*

起動ドライブじゃなきゃ、そのまま使えるでしょう。

DVI情報広場（http://www.geocities.co.jp/SiliconValley-Bay/9439/）より
http://www.geocities.co.jp/SiliconValley-Bay/9439/

こんな記事もありますが僕もクリーンインストールをお勧めします。
XPだとインストーラーからクイックフォーマットもできるので便利なんですけどねぇ。

みなさん、ありがとうございます。
クリーンインストールをしました。
やはり精神衛生上すっきりしましたし。ありがとうございました。