アップデートしましたが、今のところ問題ないです。
IDEドライバーはALiより現在Ver356が最新と思いますが
アップしてみるのもいいかも、すでに最新でしたらゴミです。

私もＦ４に上げました。
あれって、説明文が無いのでどう言う更新だったのかわかんないんですよね。
（それでも入れるのは「無謀」だな）
私はＲｅｖ４．１マザーなんですが、ＡＴＡ６６未対応なのでＦ３だと
ＢＩＯＳのＩＤＥチェックでエラーが出ていたのがＦ４ではエラーメッセージが
出なくなりました。さらに、ｐｙｏｎさんのおっしゃったようにＩＤＥドライバーの
再登録を要求されました。現在Ｗｉｎｄｏｗｓ９８ＳＥ−Ｍｅ−２０００で
問題無く使えています。
恐らく、大容量ディスク対応だろうと勝手に思ってます。

出た瞬間突撃していましたが(危険)、今のところ問題ないです。
KAME@九州さんが言っておられるのと同じかもしれませんが、F3でATA66用のケーブルがつながってないよ、なエラーが出ていたのが出なくなりました。
K6-IIIE+のWriteAllocateが起動時にONにならないのは変わっていない…と思いました。

Windows98とWindows2000で普通に使えています。
ドライバは最新のものにしてあります。

みなさん、色々教えてくださりありがとうございます。
なるほど、ハードディスク関係で変更が若干あったと
いうことかもしれませんね。私のところでも今のとこ
ろ安定しています。