まずはデバイスドライバを違うバージョンの物に入れ替えてみることですね。
WHQLの最新版は、僕の知る限りでは14.10です。
リファレンスドライバは一気にバージョンが飛んで21.81というのが公開されています。

もしかして、YMF-7X4のチップ搭載のサウンドボート使ってませんか？
それだったら、ビデオカードのドライバのバージョン上げても意味無かったよ
うな気がします。＜もし試されたら教えてください。
どうしても嫌なら、サウンドカードのドライバをWDMにすれば良かったと思い
ますが機能がかなり減ります。

その現象は、むしろ新しいバージョンのドライバで起きるように思います。
具体的に言うと、Detonator3以降から。

Detonator2以前のドライバを試されては如何でしょうか。
3D系の速度が落ちますが（3Dベンチ系で1〜2割程）。

first さん　Xwave6000　YMF754チップ使っています。
違うバージョンのビデオドライバー使ってみたんですが　それにすると
S端子のビデオチップが認識されないんです。
ドライバー戻したら　やっぱり色が一部変色しています。
サウンドカードを交換して見ようと思います。

マザーは違うので、参考にはならないかもしれませんが、ASUS A7V Creative 3DBlaster(Geforce2MX)とXwaveMaster+Windows98SEででました。

結果的にはBIOSのVerUP（1004D→1005C）でおよびWindowsMeの新規インストールで
ウソのように直りました。

＃その後DVD再生のガタツキに不満がでて、RADEONに変えたら全くでなくなりました。
＃GeForce特有なのでしょうか？

私が知ってる範囲で補足します＜もちろん情報が正しい保証はありませんが・・・
GeForce系のドライバとYMF系(ただしVxD系)のドライバでスタートボタンの表示が
破壊されます。少なくともnVIDIAのリファレンス6.50、12.41(WHQL)で確認してます。
どちらのドライバが悪いのかは分かりませんが、次のうちどれかでお好きな方法で。
対処法としては
1.nVIDIAのリファレンスのドライバではなくカノープスのドライバを使う
2.YMFのVxD系ドライバではなくWDM系のドライバを使う
3.無視する
対処法の問題点
1.の対処法はカノープス社製のカードじゃないとだめ(多分・・・何か方法ないかな)
2.ヤマハDS-XGの設定項目が減る
3.見た目が・・・・起動した瞬間から壊れているわけではないと思いますが・・・

私見として、2K等でこの症状が起きないのはWDMドライバを使用のためと思います。
サウンドカード交換でも直ると思いますが、YMF-7x4系では意味無いので、それ以外の
チップのカードになりますが、SB等では多少の出費がかかり、安いもので代用するくら
いならXwave6000にWDMドライバを適用したほうが良いように思えます。
WDMドライバは最近のものにはついてますし、ついてなかったら他のメーカーのドライバ
でもOKの場合が多いです。(物により2k/NT用のドライバって書いてあるかも、でも9Xと
両方で利用可、またメーカによる違いもほとんど無し)
景気回復のために新しく購入されてもいいかも、新SBってどうなんでしょうね

ちょっぴり試してみました。経過報告です。
1.ためしにサウンドカードを同じFMF系の724チップのものに交換してみました。
やっぱり　同じように不具合が出ます。
2.オンボードのサウンドに変更してみました。今のところ　画面上は
不具合は出ていません。ただノイズは増えました。
いまのところ　以上です。
やっぱり　ビデオドライバーとの愛称が悪いみたいですね。ぶつぶつ

ログインしなおすと綺麗にはなります、、、が解決にならないか。

スタートの文字や旗の画像、windowsという画像を置き換えることが出来るソフトがあり
ます。それと適用すれば一時的に、きれいになりますが、すぐに汚くなります。
汚くなるたびに適用すればいいのですが、面倒です。
ログインしなおすと言うのも多分、この方法と同じなような気がします。
オンボードサウンド使うならずっと問題ないと思いますよ。
ただ、私も全ての確かめたわけではないので、結果報告有難うございます。
それと、YUさんが言われるnVIDIA21.81で「S端子が駄目+ボタンが壊れる」でしたよね？

ログオンしなおすとほんの一時的に戻りますが　画面を少しいじっているうちに
不具合が出てしまいます。nVIDIA21.81についてはまだ試していませんが
ほかのメーカーのMX400搭載S端子つきをためして見ましたがS端子については
本来のドライバーしかうまく認識できませんでした。ビデオBIOSとの兼ね合いが
あるかも知れません。ちなみにほかのメーカーのドライバーに変更しても
スタートボタンの不具合が出てきます。模様は多少違うようですが

後はAW64ゴールド手元にはあるのですが　スピーカー端子がピンプラグなので
持っているスピーカーには使えません。　

ビデオボードのドライバ変更とサウンドボードの変更はされたようですが、サウンドボードのドライバ変更は試さないんですか？