どうも、この掲示板では初めてです。
さて、TYAN S1854(9900YA) + Celeron800@533A + IBM DJNA-371350 + G400SH16MB
OS:Windows2000という構成で使っていたのですが、
ここでの書き込みを元にＨＤＤの転送モードをチェックしてみると、
設定はDMA転送になっているのに現在の転送モードはPIO転送になっていました。
＃HDBENCHで測ってみても4000前後ぐらいしか出てませんでした。
＃今まで気づかなかったなんて.....計算専用サブマシンだったし.....

で、過去ログやらネット検索やらしていろいろ試したのですが、
1)ケーブルのチェック（交換、コネクタの位置、方向など）。
2)一旦PIOモードにして再起動、再度DMAモードにして再起動。
3)IBMのツールでATA33相当に落とす。
4)VIAのドライバ（ただしWIN2K用にはバスマスタドライバは無し）アップデート。
5)BIOSを最新に（って、もとから最新の1.07でした）。
6)BIOSの設定確認。（といっても出来るところはあまりないようですけど）
（ちなみにCeleronはAOpenの変換カードでslot1に刺してます）

万策つきました。
で、荒療治で他のマシンとマザーボードを入れ替えて現在は正常です。
（MSI MS-6340+Duron600、superPIでは15%ほど速いです＞Celeron800+Win98SE）
一応自己解決（？）してはいるのですが、後学のためにお教えください。
相性？なのか、Windows2000の問題なのか、それ以外の問題なのか？、
果たして解決方法はあるのか？、です。
よろしくお願いいたします。