組み立てた状態だと本体の電源から電源供給されるので問題ないでしょう。
取り外した状態で電源が切れるとCMOSがクリアされたのと同じ状態になります。
寿命についてはちょっとわからないです。

寿命については、一般の電池同様に、種類によって違います。（サイズや構成物質の違い等。）使う環境にもよりますが、3〜5年ぐらいと言う話もあります。（腕時計の電池等と同じかな。）
PCの電源未投入時に、バックアップ電池の寿命が来ると、BIOS内の保持情報が、消去される（情報保持のための電源が無くなるために、消えてしまう）状態になりますので、カレンダー機能や、BIOS内のデバイス設定などが、初期化されてしまいます。