WIN98の方のHDDなどをきちんと共有するにしていますか。
１度確かめてください．

WIN98からWIN2Kが見えないのはWIN2Kにユーザー登録してないからです
たとえばWIN98のコンピューター名が「PC」という名前だとすると
WIN2Kでコントロールパネル→ユーザーでユーザーの追加でWIN98の名前である
「PC」という名前を登録します、そうすれば見えるようになると思います。

あと、ユーザーのプロパティで「パスワードを無期限にする」にチェックを入れて
ユーザーの一覧の上「このコンピューターを使うには、ユーザー名とパスワードを
入力する必要があります」のチェックを外しておけばアクセスするたびにパスワードを
入力せずにすみます。

長くなってわかりにくけど参考にしてみてください。

あと、WIN2KからWIN98を見るのに時間がかかるのは僕もわかりません＾＾
どなたかわかる人教えてください

両機にTCP/IPのIPアドレスをつけてありますか？
それか、両機のプロトコルにNetBEUIを試してみてはどうでしょうか？
また、両機のユーザー、パスワードを統一すると、ネットワークで繋ぐ時、いちいちパスワードを聞かなくなります。
（Win2000からネットワークをみる場合はWin98と比べると遅いです。セキュリティを保つためだと思うのですが。）

＞ＷＩＮ２Ｋの方からＷＩＮ９８が見えません。
どういう風に見えないのか（例えば相手PCが表示されないのか、エラーがでるのか、など）で対策も変わってくるのですが、ここでは一応両機のLANカードは正常に動作しており、共有設定やユーザ登録も問題ないものと仮定します。

プロトコルは何が入っていますか？もし複数のプロトコル（TCP/IPとNetBEUIなど）が入っていたら、２台ともTCP/IP以外のプロトコルは全て削除し、全てのサービスとクライアントをTCP/IPにバインドして下さい。その上で２台のIPアドレスが同じネットワークに属する（例えば192.168.0.xxxでサブネットマスクが255.255.255.0など）こと、２台とも同じワークグループに属すること、Win2000とWin98で同一ユーザ名、パスワードでログインしているかどうか、を確認して下さい。

これでダメなら、ユーザやワークグループの設定ミスの可能性が高いと思うのですが…案外クロスケーブルで直接つないでるとか、共有設定はしたけれど、実際にドライブを共有指定していないとか、或いは２台の起動順序を変えてみるとか…/(^_^;;;

いろいろと弄る過程の中でもう一台が見えてる時もありましたが、現在は見えていません。頑張って見えるようにはしますが、見えている頃はアクセスしようとするとエラーがでていました。内容は忘れてしまいましたが。

ｉ９６９６８さんのクロスケーブルの表現からするとクロスケーブルはアウトと言うことでしょうか？当に今クロスケーブルなのですが。

＞クロスケーブルはアウトと言うことでしょうか？
ダメというわけではないんです。クロスケーブルでLANカード同士をつなぐと、相性がでやすいので（ネゴシエーションとか）。もし相性なら、速度固定のHUBをはさむと突然見えたりします。要するに私のRes.は、全ての設定が正しいものと仮定して、相性をできるだけ押さえる方法を書いただけです。起動順序を変えるというのは、実際にこれで問題がなくなった例がいくつかあったので…

　凪さん、はじめまして　　
機種と、LANボード名が書かれていないので、推測ですが・・・

　私も、家庭内ＬＡＮで、２台のＰＣをつないでいます。
片側が、WIN2Kと、WIN98　もう一方がWIN98です。WIN98では、NetBEUIで
接続できたのですが、（少しはまりましたが・・・）,WIN2Kでは、さらに
はまりました。LANボードのドライバーが正常に組み込めなっかたからです。

　経過　1.システムが安定しないので、HUBを、追加しました。私の環境では
　　　　　クロスケーブルでは、エラーがでてしまいました。また、自動電源
　　　　　断はしないに、設定しました。
　　　　2.administratorで、アクセスして、ボードメーカーの推奨する
　　　　　ドライバーを、インストールしたら、正常になりました。
　　　　　（administratorで、アクセスしないと、推奨ドライバーが
　　　　　　組み込めなっかた。　　　(^^;)
　　　　　
　　　　　　上書きインストールでは、ドライバーは、組み込めたのですが、
　　　　　LANボードを外して、WIN2Kを、再インストールしたら、はまっちゃ
　　　　　いました。