はじめまして、どなたかご存知でしたら教えていただきたいのですが。

自作機なのですが、ハングアップ等でパソコンをリセットすることになり、Windowsを再起動
すると
「Windowsの保護エラーです。再起動してください。」と出ます。

それで、再起動をするとまた同じメッセージがでる。しょうがなく起動時にF1キーを押して
ステップして入るやつでWindowsを起動するとWindows９８の画面まではいくのですが
なにやら動作が不安定。

このような現象の場合、引っかかっているファイル(壊れた?)というのは何になるのでしょう
か。

このような現象をさけるためにバックアップしておくべきファイルなどがあれば教えていた
だきたいです。

よろしくお願い致します。