キーボードのキーが押されたかどうかを調べる方法はいくつかあります。
Enterを押して13が返ってくるのはキャラクターコードの方ですね。
Altキーはキャラクターコードを出力しないので、スキャンコードというのを調べる必要があります。
自分でプログラムを作成しているのだと思いますが、言語は何ですか？

ＲＥＳありがとうございます
言語はＶｉｓｕａｌＢａｓｉｃです
あるアプリケーションをＳｈａｌｌで起動した後
Ｓｅｎｋｅｙｓでそのアプリのショートカットキーを自動で押させたいなと
思っています

プログラミング関係の問題なら、
下記掲示板で質問されてみては いかがでしょう。
こちらの方が、Resが付きやすいのでは無いでしょうか。

「プログラミング同好会」
http://www.taillight.com/program/

もう遅いかな・・・？
こんなページを偶然見つけました。キーコードを検出するプログラムです。自分で試してないので、機能等は分かりません。
http://www.i-chubu.ne.jp/~y-tutano/soft.htm

とか言いながら数分もかからないので試してみました。
ＡｌｔとＰＣ−９８の「ＧＲＰＨ」のキーコードが同じなら、キーコードは１８になるはずです。