今のマザーはAGPとPCI1、PCI3とPCI6、PCI4とPCI5といったようにPCIの位置で強制的に
IRQ共有してしまう（P3B-F等）ので手動は意味が無いと思います。
MS-6163のマニュアルにそのように書いていませんでしたか？。

不具合が出るのは、多分マザーに挿すボードの順序によるものだと思います。

P3B-FにAGP側からG400DH、100Base、SC-UPCI、Ultra66、AD-TVK501、YMF724、MX300
私の環境では上記6枚挿でもIRQは3箇所空いており、安定動作もしています。
（100Base、SC-UPCI、Ultra66の任意からブートもできます）

同じマザーを使っている者としては、非常に勿体無い気がしてならないんですが。
MS-6163、まだまだ使えると思ってるんですが・・・・・。i815Eを使ってる方には申し訳無いんですが、BXを超えるチップには思えません。AGP4Xに対応していようが、規定外ではあるにせよFSB133でBXを超えられなければ意味無いですね。

ＤＯＳ/Ｖ機のほうが好きですが
ＰＣ９８のセットＵＰユ−テリテイ（優秀）にはかないません。
現在ＡＳＵＳのＣＵＳＬ2（815Ｅ）使ってますがＢＩＯＳがまだ不安定の
ようです。
ＦＳＢを7Ｘ140＝980にセットしてあるのに　ある日突然7Ｘ133＝930に
なってたりします　ＢＩＯＳの熟成を待ってます。　あとはトラブルはないですね。
おいしい特徴としてはＦＳＢが１メガ単位で変更できるとこれでしょうか
アポロよりは良いと思います。
個人的には気にいってます。

お返事ありがとうございます（今日も仕事だったので見るのが遅くなりました）

ＫＯＵさん：
マニュアルの記述はちょっと思い出せないのですが、ＩＲＱが強制的に共有されてしまうという事は経験しました。
このマザーではAGPとPCI(2)、PCI(1)とPCI(3)とPCI(5)が共有されてしまいます。
単体でIRQを所得できるのはPCI(4)だけでした（ココにキャプチャーボードを差しています）
各カード類は差込み位置を何度も試行錯誤して現在の状態（フリーズは時々という程度）に落ち着きました。

エロじじぃαさん：
仮にi815Eマザーを購入した場合、MS-6163は一時退役させますが、3rdマシンとして復活させる予定もあります。
PC-98や現ATマシンからの旧部品もありますので、OSと入力機器と電源さえそろえれば・・・
もちろん今回は購入を見送る可能性もあります。
現マザーを無駄にするつもりはありませんので安心（？）してください。

S.Kさん：
IRQは競合していなければ共有しても問題ないのでしょうけれど・・・
A型のワタシとしてはIRQの共有は好みじゃないです（笑）
やっぱり98での「PCIセットアップユーティリティ」は有難かったです。
CUSL2も含め、もうちょっと検討してみます。