私は同じ世代のVS26D/MZCA1を使ってlineから録音していたことがあるのですがマザーボードの入力端子から録音するとハードディスク等からのノイズが乗ってしまうために(乗ったり乗らなかったりするんですけどね)ローランドのUA-30というオーディオの入出力デバイス(デジタルアナログ両入出力端子がついている)を導入しました。

　MDからの録音でしたらカノープスのMD-port(これはデジタルのみ)なんかを導入してはどうでしょうか？ただＵＳＢ機器は録再中にCPUにほかの負荷がかかると音がとぎれてしまうんですが。CD-Rに焼くのでしたらデジタル端子を用いた方が音質が維持できるますし。
　注意点はMDの素材がCDからのコピーだとさらなるデジタルコピーに対してはSCMSというコピーガードがかかってしまうということ。
　ほかにPCIバスのサウンドボードもあります。

　お金をかけてノイズレス環境を作るかノイズに目をつぶってお金をかけないかのどちらかにするしかないと思います。マザーの端子を使ってノイズが乗ってまたやり直しとかで時間を食われますし、ハードディスク上のWAVEファイルのコピーと違って素材の実時間そのままかかりますから。

レスありがとうございます。
そうですか。原因はマザーの方ですか。
自分のマシンだけがそうなるのかなと思っていたのですが、
同型機の方も同じ現象が出ていたのですね。
やっぱりサウンドボードなどを増設した方がよいようですね。
ありがとうございました。

ＶＳ２３Ｄ使いのあじです。
と、いうか、ＬＩＮＥ入力端子からの録音ってどうやるのですか？
フリーソフトと有りますが、どのようなソフトなんでしょうか？
ＬＩＮＥ入力端子とＭＤをつなぐケーブルを買ってきたのですが、
やりかたがよくわからなかったので・・・。

出来れば教えてください。よろしくお願いします。

　初代＆２代目までのＮＸだと「コントロールパネル」−「マルチメディア」−「オーディオ」の録音の項目で「Audia3dなんとか」っていうのが本体のLineデバイスのことだったと思うのでそれを選んでください。初代のＮＸは今手元にないので正確なデバイス名は分からないです。あとOSがWIN95のままだったら「マルチメディア」っていう項目名ではなかったような・・
　ソフトごとに録音に使うデバイスを選択する場合もありますがその場合インストール時点での「コントロールパネル」の設定が通常そのソフトの初期設定になっています。
　１分以内でしたらWIN付属のサウンドレコーダーでできます。それ以上はVectorやDOWNLOAD.COMからフリーソフトを落としてくるか市販のソフトを利用してください。ちなみにほとんどのサウンド入出力周辺機器にはソフトがついてきます。

　W.G.さん＞
　すいませんOSがWIN95のままでアップグレードしていなかったらＵＳＢオーディオデバイスは使えなかったことを思い出しましたので書いておきます。

追伸
　ＭＤレベルの音質を維持したいのならサンプリングレートは44100Hz/16bitのＣＤと同じものを選んでください。

早速サウンドボード（YAMAHA YMF744）を買ってきて試してみました。
ノイズの方は解消されたようです。
ありがとうございました。
フリーソフトですが、元初代NX使いさんのおっしゃるとおり、
Vectorで手に入れたソフトです。
http://www.vector.co.jp/