固定ディスク起動メニューはPC-98にしかなかったと思います。AT互換機やPC98-NXでは市販のソフトを使わないと同等の機能は実現できなかったような・・・(^^;;)。

BIOSのことかな？一応、NXでも起動選択は出来ます。

起動時のF2押しでBIOS設定画面が出ますが、そこの起動メニュー内の「ハードディスク」にて「プライマリマスタ」「プライマリマスタスレーブ」「セカンダリマスタ」「セカンダリスレーブ」を選べます。ただし、そこにHDDがBIOSレベルで認識しているのが条件です(認識してないと選択できません。)

で、お察しのとおり、１物理HDDに１つのOSだけがインスト可能です。
やはりPC-98のようなパーティション毎の起動設定・・とまでは器用に行きません。
それに、基本的にAT形式の管理なので例の基本領域と論理領域の絡みでドライブ順のつじつま合わせが結構キツいです。(--;

今、Windows2000RC2環境とNT4環境のデュアルブートを四苦八苦しながらやってて、このへん色々と試してるので。分かっている範囲で書いてみました。(^^)

素直にコマンダーとか使えば良いのでしょうけどね。(^^;

前に色々といじってみたのですが、２台のＨＤＤ両方ともアクティブにしないと
まともに動かなかったと思いました。

　起動メニューですが、さすがにパーティション毎とはいきませんが、フリーで手軽なブートマネージャーならMultiple Boot Managerというのがあります。ちなみにBIOSをいじることなく二台目以降のHDからもブートも可能です。私はこれでWin2kとWin98のマルチブートにしてます。確か、領域の作成もできたと思います。私的には市販のブートマネージャーよりもこっちの方が便利だと思っています。起動メニューをカスタマイズしてきれいなGUI画面にすることも可能です。ここにあります。
　
　http://www2s.biglobe.ne.jp/~elm/fsw/mbm/mbm.html
　

皆さん、色々アドバイスありがとうございます。早速参考にさせていただきます。

＞豆さん

これは知らなかった、試してみようっと。

　自分で使っているくせに大ボケかましてました。パーティション毎の起動全然OKです。何を考えていたのやら。
＞かげまるさん
　使い心地はどうですか？