こんばんは、はじめまして。
>Photoshop5.5が動かなくなる件
(Photoshop 5.5 をインストールしたフォルダ)Plug-InsAdobe Photoshop OnlyExtensions
にある MMXCore.8BX を削除すると利用することが可能です。
ただし、この場合は MMX や SSE を利用することができないので処理が遅くなる可能性が
あります。
>3D 関連
I-O のサポートによると GA-TNT232/PCI などのボードを利用すると問題ないということです
RYU さんが書き込まれているように、標準付属の RIVA128 の 3D 機能を利用できるように
なるパッチがベータ版ですが公開されています。
http://www.iodata.co.jp/products/cpu/pkp2anx/patch.htm