問題ありませんよ。

参考になるかわかりませんが、私の家のＶＳ２３Ｄについてくる内蔵モデムボードですが、現在はずして使用していますが、これといった問題は起こりませんでした。故に、たぶんＮＸ２０でも大丈夫だと思います。

ＭＡ４５Ｊも一緒でしょうかねぇ〜？

モデムボードを外すと異常が・・というのは単なるNECの脅しと思って良いカト。(^^;
まぁ、何かあったらそれはモチロン自己責任ということになりますが。

VS26DMZDA1ではモデムボード外しても何の問題もありません。
モデムボードが刺さっていた場所に他のカードを入れても今のところ問題ナシです。
スロット１：GA-SV432-PCI（もとモデムカードの場所）：
スロット２：GV-DVD2-PCI
スロット３：FastEther PCI-TX
スロット４：SC-UPCI

ただ、引っこ抜くとき、マザーから繋がっていた二本の信号線（？）がものすごく硬くて、大変でした。また、PCIスロットから外すのもずいぶん難儀したような記憶があります。

生産ラインでインパクトで締めて、更にネジロック剤とかで固めてるからカモしれませんね。(^^;