え〜と、まず環境を明確に示して下さい。確かに［12788］を読めばある程度分かりますが、それはあくまで別スレッドです。それと、［12788］では、VGAカードが何なのかが分かりません。
従って、最低限VS16Fの現在のスペックに加えて、
1)VGAカード搭載GPUの種類と型番
2)ターゲットとなるAVIファイルの使用コーデックとファイルの形式
　（なぜこれが必要になるかは、自分で学んで下さい）
3)AVIファイルの作成方法
ぐらいは書き込んで下さい。そうしなければ、多分答えようがありません。

現状で推測できることは、恐らくCPUが遅くて、コーデックを処理し切れずにコマ落ちするのか、元のAVIファイルをキャプチャーするときに、コマ落ちしているのか、どちらかだろうということ位です。
前者ならばCPUを速くすれば解決するかもしれませんし、後者なら、元ファイルをコマ落ちしないようにキャプチャーし直すしかありません。

いずれにせよ、VS16Fに多くを望むのは無理です。［12788］で改造ＭＡＮ さんに指摘されたことを、真剣にご検討下さい。

はっきりいえばお金のかけかたを間違っているかと。↓の
http://www.at-mac.com/dos/used/2005/11/051101/051101-simotuki.htm
HDつきのどれ(1500円から3500円くらいのでOK)を買っても今より速さを実感できるでしょう。