最近似たようなスレッドがあったようですが、何故か消えているようなので
新規で失礼します。

私も最近、VS20C(CPU:K6-3 400MHz、OS:Windows98SEにアップグレード済)に
ビデオカード（玄人志向GF2MX400-PCI64[nVIDIA GeForce2 MX400])を増設
していてトラブルに遭遇しましたが、その対処法が何とかわかりましたので
ここに報告しておきます。

トラブルの内容自体はGeForce2 MX400のドライバを認識させたあと、
再起動するとWindowsが起動しなくなるというものです。
しばらく原因がわかりませんでしたが、結局、VS20Cのオンボードビデオのドライバ
(Cirrus Logic 546X)とMX400のドライバの相性が悪いのが原因のようでした。
2つのドライバが同時に読み込まれるとWindowsがフリーズしてしまうようです。

VS20Cはオンボードビデオの機能そのものを無効化することができないので、まず
オンボードビデオのドライバを強制的に「標準ディスプレイ アダプタ(VGA)」に
変更し、そのあとでMX400のドライバをインストールすると増設したビデオカードを
正常に使用できるようになりました。
なお念のため、デバイスマネージャでオンボードビデオを使用不可にしています。

参考まで。