まずもとのＭＭＸの１６６で動くか確認してみてください。多分セーフモードになると思います。僕も同じ目にあった一人ですが、パッチを入れる前は３回に１回の確率で起動できたのですが入れたらセーフモードでしか起動できなくなりました。ＭＭＸにもどしてみてもダメで結局バックアップをとって（運良くＨＤＤ２台つないでいた！）WIN９８にしました。僕の私的な結論を言うともしＫ６を使いたいならあきらめて９８にアップした方が早いと思います。コストはかかりますが安全ですし、なりしろこの件に関してはＭＳにもＮＥＣにもサポートはされないと思うので。もし９８がイヤなら再セットアップになるかと思います。ですがここには長年ＰＣに慣れ親しんできた方々が沢山いらっしゃいます。もしかしたらソリューションを出してくれる人がいるかも知れないので少し待ってみるのも良いかも知れません。ゴミレスかも知れないけど参考までに。

私も以前は下駄+K6-2でWin95を使ってましたが頻繁にエラーが出て安定しないのでWin98にしたクチです。
特別な理由で95を使わなければいけないのでなければ、やはり98にしてしまうのが安定させる近道でしょうし追加コストも一番安いと思います。

早速のレスありがとうございます。（残業続きで投稿後すぐダウンしました（涙））
この際なので９８にしてみます。僕のＰＣだと遅くなるのではと思っていたので
実行してませんでした。（ただのナマケモノ？）
うまくいきましたら、結果報告したいと思います。
ありがとうございました。

うちのマシンもVS16Fです。ただ、改造した時点でWIN98でした。
それから、CPUアクセラレーターK6-2@366にしました。
この質問とは関係なさそうですが、同じ機種ということで。

実は下駄＋CPUを買った店で「NXでMMX166ですか？そんな機種あったかなぁ」などと
言われちょっとショックでした。（ちなみに某○ソコン○房でした。悪気はないですけど）
それで今Ｗｉｎ９８をインストールしようとしたのですが、ＣＤドライブが認識されてなくて
またつまずきました（；＿；）。どうしたら認識させられるのでしょうか？
それとＷｉｎ９８のＣＤで９５から９８へアップできるんでしょうか？（ううっ初心者だ）
場所違いかもしれませんがＫ６関連ということでご教授いただきたいです。

　NECの９８へのアップグレードキットが無償でもらえるのでもらわないと不都合が生じるかもしれませんね。というわけでお近くのNECのサポートセンターでもらいましょう。もし持ってたらゴミレスだけど。

ネットに接続できるのだから、サポートキットはNECのサイトから落とした方が早いんじゃないでしょうか。近くにサポートセンターとかがない場合ですが。それと、OSのインストールの際は元のCPUに戻しておいた方が無難ですよ。CPUが違うとインストール途中で止まることがたまにあります。
CD-ROMの認識ですが、WIN98のCD-ROMの内容を適当なHDにコピーしてそこからセットアップを実行すればCD-ROMを使う必要はありません。Configとかをいじってデバイスドライバを組み込めばCD-ROMを使えますが、DOSを知らないのであれば、セットアップファイルをHDにコピーするやり方が一番簡単です。

いろいろなアドバイスありがとうございました。
サポートキットは持ってませんでした。（汗）
これから早速試してみようと思います。助かりました！
自力でいけそうな感じです。（おそらく・・・）