まず最初にご友人に苦言を一つ。
HK6-MD400-V2は取扱説明書入ってますよ。もしマニュアルのない中古を購入されたのなら、それは承知の上で購入されているはずですから、そういう場合は自力更正が基本です。マニュアルがないことを店員が事前に知らせてくれなかったのなら、堂々と苦情を言うべきです。
本来K6-2は倍率固定ではないのでM/B側で倍率設定すべきですが、HK6-MD400-V2側で6倍に固定しているので倍率設定は不要です。又、BIOSに関してはPu さんのお示しになった対応表に注釈がありますよ。それ以上細かいことに関しては、キーワード「HK6」と「VS20」で過去ログを検索してみて下さい。
接続する電源ラインはHDDを避けるべきでしょう。
それとVS20ということなので、もしまだWindows95をお使いでしたら、CPU交換前に必ずユーティリティをインストールするか、Microsoft社の対策モジュール↓をインストールして下さい。
http://www.microsoft.com/japan/win95/modules/at_711.htm