もう一度マザーボード上のコネクタのピン数を数えなおしましょう

そうですね、Ｐｅｎ７５のＣｘ２のコネクタが通常のＩＤＥコネクタ（４０ＰＩＮ）
ですからね。ＦＤＤのコネクタと間違えるわきゃないし。つなげないはずはないし、最低でも
ＣＤＲＯＭとしては使えるはず。ＣＤ−Ｒとして活用できるかどうかは別として。

すみません コネクタの件は私の勘違いでした。 で、つないだのは良かったのですが、
起動の時にシステムディスクを入れてください と表示されてしまいます。
CD-R側のジャンパの設定はマスタ、スレーブ、CSELと試しましたがどれもだめでした。
よい決法がありましたら是非教えてください。

内蔵CD-ROMは外して置き換えたのですか？それとも、CDを2台接続した状態で使おうとしているのでしょうか？
とりあえず内蔵CD-ROMと交換する形にして、ジャンパはマスターの設定にしてください。
それから、CD-Rを外したらWindowsが起動するのか、確認してください。

おせわになります T-KOBAYASHIです
私のマシンはV200（上記のV166は間違いでした）なので、
デフォルトでSCSIのCD-Rがついています。なので内臓IDEのCD-R（ROM）
は今回のものが初めてです。
ジャンパはマスターにしています。
あと、CD-Rを外したら起動できました。

HDDはどんなふうに接続されていますか？
ATAPIのCD-Rはセカンダリのほうに接続していますか？

ありがとうございました。 無事に接続することが出来ました。
セカンダリ接続でジャンパをマスタ設定にしたらうまくいきました。
OSの起動時間がちょっと長くなったのが気になりますが、増設したCD-Rがうまく動いて
いるようなんで気にしないことにします。
いろいろと助言ありがとうございました。