BIOSを外しただけではダメな場合も多いです。そもそも皆さんが高いお金を出してでもPC-98用のGAを買い安価なAT互換機用のGAを買わない理由は「どうあがいても使えない場合が多いから」ですからねぇ。VGA BIOSの問題を解決できてもドライバの問題もありますし素直にPC-98用ボードを買われた方がよろしいかと（無論、人柱になられるならそれは有益な情報にもなりますので止めはしませんが・・・・^^;;）。サウンドボードはそのままでPC-98で使える物が結構あります。

なお、Windows2000でPCI版のRIVA TNT2ボードの動作が確認されたようです。

GAについては原則BIOSを飛ばし、NT4.0でなら使えます・・・が、
ドライバがBIOSを見に行くようなものだと使えないこともあります。
また、nVIDIA系のものは動いたという例がほとんどありません。
#9やmatroxのものは結構動くようですが。
Win2000だとRIVA128/TNT2が動いたという報告がありました。
サウンドボードはそのまま差してドライバを入れれば「大体は」使え
ます（例によって無保証）
PC98で動作実績のあるグラフィックボードとして(括弧内は
チップベンダ名）・・・
MillenniumII,G200,Millennium(matrox)
Revolution3D(#9)
Monster3DII,Obsidian2 X-16/24(3dfx)
RIVA128,MVGA-NVTNT2MP(Win2000 only) (nVIDIA)
3D Blaster Exxtreme(3Dlabs)
こんなもんでしょうか。OpenGL系のもの（Accel MXとか）が使えたという
結果もあります。

ほかにもRendition系のチップも動くものがあるようですし、#9のRevolitionIVやImagine128もOKではあります。
ただ、かのぷのRiva128は駄目ですねえ(^^;;;;;
また、ATIも駄目でした。でも、RAGE128あたりならば動くかもわかりません。
ELSAのようにAT互換機専用に作っているわけではないGAは動くものが多いと素人考えで予想しています。
#SynergyII/PCI(TNT2)が中古で出てきてくれれば買うんだけどねえ.....

みなさんBIOS飛ばしでリセットするタイミングがどうとか苦労なさっているようですが、BIOSファイルの末尾の1バイトをバイナリエディタで書き換えて、チェックサムの狂ったデータを書きこめば、簡単確実に認識しなくなりますよ。
まあ、この方法も、書きこみ時にサムをちゃんとチェックするボードでは使えませんけどね。