手元の青札ステップガイド（PC-9821V-GB12）では，PC-9821V-FD2が青札デスクトップの2台目FDD増設用キットとなっています．ただこれのFDDはフロントベゼルつきなんですよね．ですのでパネル部はPC-9821XA-E02と違い，2台目のFDDのところがFDD開口部の形でなくフロントベゼルの形になっています．
検索したら画像がありました：
http://www.98-shop.com/p-2304.html

流星用のPCカードスロット増設アダプタPC-9821V-E01のパネル部の下側開口部も同じような形をしていますので，PC-9821V-FD2のパネル部はPC-9821V-E04のパネル部でも代用できるんじゃないですかね（共通？）．
私はPC-9821XA-E01のパネルとベゼル付きFD1231Tを組み合わせて，PC-9821XA-E02の代用にしています（ベゼルよりパネルの開口部の方が小さいので，見栄えもさほど悪くありません）．ベゼルはPC/AT互換機用のFD1231Tのものが使えます．

流星用の2台目FDD増設用キットはPC-9821V-FD1のようですね：
http://weblabo.griffonworks.net/dorlog/2nddorcom/98maniacs/199906-/sled01775.html
121WAREの記載では，V200／SZ・S7,V166／S7・S5対応となっていますが・・・

PCカードスロット増設アダプターの開口部にベゼル付のFDDを使う増設セットがあったのですね。
98ショップの在庫情報もありがとうございます。

実はタワー用のFDD増設キット(5インチベイを使うやつ)も未使用品を確保できているので(何故か岐阜で売ってたw)、
98ショップでPC-9821V-FD2を買って手持ちのV166/S5に取り付けるか、新たに青札タワーの本体を買うか検討してみます。

FD1231Tは、製造時期によってフレーム構造が変更されており、AT互換機用のフロントベゼルの移植をする場合にはその点に気をつける必要があります。
両者にはトップカバーに互換性がないです。

フレーム構造によってはベゼルの有無でトップカバーのフロント部分の形状が変更されているので、トップカバーも交換が必要になります。

あとPC-9821V-FD2用のFD1231Tは、イジェクトレバーが長い特殊品になるので、それ以外を使うとイジェクトが面倒です。