2GB(2,000,000,000B)のHDDをMS-DOS3.3xの最大パーティション容量で割ると、
15領域しか作れません。

・・・とかいう話では無いと思うので試してみましたところ、
手元のMS-DOS3.3D付属のFORMAT.EXEでは対応していないっぽいです。
装置全体を初期化したあと止まりす。

あとはサードパーティ製のフォーマッタを使うことになります。
緑電子のMDC-925Lおよび付属の大磁主を使って試したところ、
3.3B/C/Dでは1GBあたりまで対応のようです。
16領域の確保は一応できたのですが、
128MB×9番目の領域を確保する時点で、
DOSが対応していないかもしれない旨の警告が出ます。
実際、9番目の領域(I:)からはどうにか3.3Bのシステムを起動できたんですが、
10番目以降の領域には転送したはずのMSDOS.SYSが見付からず、
どうやらデータ化けしている様子です。
実質的にDOS3.3xでは128x8領域とか64MB×16領域の
1GBくらいまでと思ったほうが良さそうです。

MS-DOS3.3Dにはアップデートもあったと思うのですが
3.3Bで2GB使うのは難しいのではないでしょうか。

> 同時にアクティブになる領域の事は分かっています。
大磁主を使えばMS-DOS3.3xで16領域同時にアクティブにしてドライブ認識できます。
実際にHDDから起動するとFDDがQ:になり、
NEC推奨のCD-ROMドライブレターが使えません(笑)。

ただDOS3.3以外を立ち上げると先頭4領域しか見えないんですよね。orz

2GB制限のある95aなんかでは残りの12領域がアクティブであっても
(GUIが立ち上がる前までは)見えません。

KAZZEZ さん　返信ありがとうございます。２ＧＢ/１６区画でなくてもＨＤ先頭に３．３Ｂを１２８ＭＢ・ＤＯＳ６．２＋Ｗｉｎ３．１を１ＧＢ・残りをＷｉｎ９５と考えていましたが３．３ＢだとＧＢクラスのＨＤが繋がっているだけで起動できないようです。一時的に外付けを認識させないユーティリティとか有ったら欲しいですね。

>３．３ＢだとＧＢクラスのＨＤが繋がっているだけで起動できないようです。
うちでは2GBのHDDで試す限りはそのような問題は起きていません。
本体はPC-9821Bf＋MDC-925LおよびPC-9821Ra266＋PC-9821-B09で試しました。
HDDはノート用のIDE2GBをメルコのSDAT経由でSCSI変換したものや、
または2GBのCFをアイオーデータのCard Dock/SCでSCSI変換したものでした。
MS-DOS3.3B-128MB＋MS-DOS6.2-1GB＋のこり95B
という領域分けを行っても、どのOSからもちゃんとコマンドプロンプトが起動できました。

いったん別のOSで起動し、HDD全体を初期化してから
(領域の無い状態で)MS-DOS3.3Bを起動してみてもだめでしょうか？
またSCSIインターフェースはBIOSが8GBクラスの大容量に対応したものでしょうか？

あと考えられるのは、MS-DOS3.3系ではフォーマット時に
クラスタサイズの選択幅が後のDOSと比べて限られている点でしょうか。
別のDOSで確保した領域が128MB以下であっても、DOS3.3Bでは不具合を起こすのかもしれません。
前述の通り手持ちのMS-DOS3.3Dで2GBのHDDはフォーマットできませんでしたが、
MS-DOS3.3Bはどのようなフォーマッタで領域確保されているのでしょうか？

KAZZEZ さん　返信ありがとうございます。ＤＯＳ５．０とＷｉｎ９５の入った２ＧＢのＳＣＳＩ−ＨＤＤをＤＯＳ３．３Ｂ・128MB、ＤＯＳ５．０・８９６ＭＢ、ＷＩＮ９５・１ＧＢにしようと思いまずＤＯＳ５．０の領域を開放しました。ＦＤＤに３．３Ｂのディスクを入れると起動してメニューが出ますがＨＤＦＯＲＭを起動させると
Ａ＞ＥＣＨＯ ＯＦＦ
Ｆｒｏｍａｔ Ｖｅｒｓｉｏｎ ４．３０・・・で止まってしまいます。
３．３Ｂのシステムディスクが壊れているのかと思い押し入れから引っ張り出した
マスターディスクを取り出して作り直しましたがやはり同じ所で止まってしまいます。
ＦＯＲＭＡＴＸを使ってＦＡＴ１６フォーマットしても３．３Ｂのシステムディスクで起動して領域を確保しようとしても同じ所で止まってしまいます。
ＳＣＳＩカードはPC-9821A-E10ボードの白いシール付きの例の奴です。
仰るとおり２GBをDOS５．０か６．２かRa43の起動ディスクでフォーマットして領域を削除してから再度３．３Bで起動してみます。

上で「起動しない」とおっしゃっていたのはOS(DOS3.3B)そのものではなく
DOS3.3付属のフォーマッタの話だったのですか？
OSが起動するのであれば単にフォーマッタの問題かと思われます。

DOS3.3xに付属のHDFORMはバッチファイルですよ。
中身は単なる「 FORMAT /H 」みたいです。
上で私が言いましたように、DOS3.3Dに付属のFORMAT.EXEは
大容量HDDだと止まってしまうので使えません(3.3Bも同様と思われます)。
それで正常の挙動と思われます(STOPキーで抜けることはできるかもしれませんが)。

FORMATXは既に確保されている領域をフォーマットしなおすものですので、
純粋なフォーマッタではありません。

前述の通り、DOS3.3x対応で大容量HDDに対応したフォーマッタを探して使ってみてください。

私が使った大磁主2.06はMDC-925Lボード付属FDの「ぐっと楽(らっく)2」
に収録されていたものですが、その後Webでも公開されました。
とりあえず"ぐっと楽2"(引用符付き)で検索すればすぐ見付かるとは思いますが・・・。
それ以上のことは控えます。

それと、PC-9821A-E10の頃のNEC製SCSIボードは
1GB以上のアドレスから始まる領域があると正常に動作せず
データ破壊を起こす可能性があると思いました。

最後の領域が始まるアドレスは1GBをぎりぎり下回るようにしてください。
たとえばDOS3.3が128MBでDOS6.2を895MBにして残りを95にするとか。

なお、その対策プログラムを公開されている方もいらっしゃいます。
http://hp.vector.co.jp/authors/VA012947/iplware/e10_pat_120.html
ご参考まで。

KAZZEZ さん　大磁主2.17が入手出来たので早速使いました。結果はうまく行きました。ＤＯＳ３．３と５．０＋Ｗｉｎ３．１、Ｗｉｎ９５の環境が２ＧＢのＨＤＤ内に実現できて満足です。
ご指摘の
「それと、PC-9821A-E10の頃のNEC製SCSIボードは
1GB以上のアドレスから始まる領域があると正常に動作せず
データ破壊を起こす可能性があると思いました。」
・・・についてですが当方のＳＣＳＩカードは物議を醸した白いシールバージョンで１ＧＢ以上の領域対応版です。
これに関してはＩＤＥ＞ＳＣＳＩ変換を使用した外付けＨＤＤ（８．４ＧＢ）で試してみるつもりです。

> 当方のＳＣＳＩカードは物議を醸した白いシールバージョンで１ＧＢ以上の領域対応版です。
そうでしたか。失礼いたしました。m(_ _;)m

ただ、SCSIインターフェースが1GB超に対応していたとしても、
前述の通りOS側が対応していない可能性があります。
私も今回MDC-925Lはver1.41の大容量対応版を使いましたが、
実際にDOS3.3BやDから1GB超の領域には正しくアクセスできませんでしたので、
間違ってもDOS3.3Bから1GB超の領域にアクセスしないほうが無難かと思います。